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应用基因芯片技探讨口腔扁平苔藓发病机制的研究
∥。.小
目 录
中文摘要……………………………………………………………………1
英文摘要……………………………………………………………………4
研究论文应用基因芯片技术探讨口腔扁平苔藓发病机制的研究
前言…………………………………………………………………刖看………………………………………………………………… 88
材料与方法……………………………………………………………9
结果……………………………………………………………………15
附图……………………………………………………………………17
附表……………………………………………………………………19
讨{仑……………………………………………………………………25
结论……………...…………..-…………………………………….3l
参考文献………………………………………………………………32
综述…………………………………………………………………………35
致谢…………………………………………………………………………44
个人简历……………………………………………………………………45
中文摘要
应用基因芯片技术探讨口腔扁平苔藓发病机制的研究
摘 要
目的:口腔扁平苔藓是一种常见的非感染性口腔黏膜疾病,不易治愈,
有一定的癌变倾向。该病好发于中年人,多见于40岁以上妇女,随年龄增
长症状加重。该病病因不明,发病机制错综复杂。近年来,口腔扁平苔藓
的癌变病例报道呈上升趋势,因此,对口腔扁平苔藓发病机制的研究成为
口腔医学研究的热点。基因芯片技术是目前国际上兴起不久且发展迅速的
一项生物技术,它在生命科学领域扮演着越来越重要的角色。基因芯片技
术是目前基因研究方面最先进、最有效的方法之一,随着生物学技术的发
展,基因芯片技术越来越广泛应用于疾病发病机制的研究,从而发现差异
表达基因。本实验应用基因芯片技术筛选口腔扁平苔藓与正常口腔黏膜组
织差异表达基因及其信号传导通路,分析口腔扁平苔藓发病相关的差异表
达基因和信号传导通路,进而对口腔扁平苔藓的发病机制进行深入研究。
方法:
1样本采集
所有病变组织均来源于2008年5月至11月河北医科大学第四医院口
腔科临床诊断为口腔扁平苔癣的患者,并经知情同意取病理时切取少量病
min
变黏膜(组织病理诊断为口腔扁平苔藓的继续保留)。标本于切除后10
内装入经无菌DEPC处理的冻存管中,然后储存于液氮罐中转运到低温冰
箱中保存。对照正常组织来源于河北医科大学第四医院口腔科无菌条件下
健康者拔智齿时切除的龈黏膜或口腔整复术中切除的口腔黏膜,保存方法
同OLP组织标本。
2芯片的制作
由上海康成技术有限公司提供的含有32050个基因的高密度基因组
芯片(phalanx台湾)。取适量(50~100mg)正确保存的OLP组织样本
6匀浆后抽提RNA。
am、260
nm和280am的吸
使用Nanodrop测定RNA在分光光度计230
收值,以计算浓度并评估纯度。用甲醛电泳试剂进行变性琼脂糖凝胶电泳,
中文摘要
格以保证后续芯片实验结果的可靠性。使用Ambion的RNA
针和高密度基因组芯片进行杂交。
3芯片扫描和图像分析
使用GenePix4000B芯片扫描仪扫描芯片的荧光强度,并将实验结果
Pro
转换成数字型数据保存,使用配套软件(Genepix
的差异表达基因和通路,以表达差异2倍为阳性,为有统计学意义。
4RT-PCR验证结果的可靠性
本实验为了排除实验结果中筛选差异基因的错误和假阳性,对
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