中华按蚊CYP6Y亚家族基因的鉴定和生物信息学分析.pdfVIP

： 昆虫 学 报ＡｃｔａＥｎｔｏｍｏｌｏｇｉｃａＳｉｎｉｃａ，Ｊｕｎｅ２０１４，５７（６）６６３－６７２ ＩＳＳＮ０４５４６２９６ 中华按蚊ＣＹＰ６Ｙ亚家族基因的鉴定 和生物信息学分析 唐　尧，乔　梁，张玉娟，车燕飞，洪　瑞，陈　斌 （重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所，重庆市动物生物学重点实验室，重庆４０１３３１） 摘要：【目的】鉴定中华按蚊ＡｎｏｐｈｅｌｅｓｓｉｎｅｎｓｉｓＣＹＰ６Ｙ亚家族基因，分析它们的结构和特征，推测其可能的功能。 【方法】以冈比亚按蚊Ａｎ．ｇａｍｂｉａｅＣＹＰ６Ｙ１作为询问序列，通过双向Ｂｌａｓｔ方法检索中华按蚊转录组中ＣＹＰ６Ｙ亚家 族基因，并通过生物信息学方法分析基因结构、特征及可能的功能。【结果】从中华按蚊转录组测序数据中鉴定出 ２条ＣＹＰ６Ｙ亚家族基因，分别命名为ＡｓＣＹＰ６Ｙ１（ＧｅｎＢａｎｋ登录号：ＫＦ７０９３９７）和ＡｓＣＹＰ６Ｙ２（ＧｅｎＢａｎｋ登录号： ＫＦ７０９３９８）。序列分析显示，ＡｓＣＹＰ６Ｙ１和ＡｓＣＹＰ６Ｙ２全长分别为１７１３ｂｐ和１８１５ｂｐ，分别编码５０２和５２６个氨基 酸。基因结构分析显示，该亚家族基因仅含有１个相位１型内含子并与其他Ｐ４５０基因形成保守的共线性分布。蛋 白结构分析显示，这２个基因编码的蛋白含Ｐ４５０特有的５个特征序列和６个底物结合位点，且均不存在信号肽，其 亚细胞定位为细胞质。３Ｄ结构分析显示，ＡｓＣＹＰ６Ｙ１有 １８条 螺旋和１３股反向平行的 折叠，ＡｓＣＹＰ６Ｙ２有 １９ α β 条 螺旋和１１股反向平行的 折叠。通过同样的方法，在达林按蚊Ａｎ．ｄａｒｌｉｎｇｉ中也鉴定出２个ＣＹＰ６Ｙ亚家族基 α β 因。系统进化分析显示，ＡｓＣＹＰ６Ｙ１和ＡｓＣＹＰ６Ｙ２分别与其他３种按蚊的ＣＹＰ６Ｙ１和ＣＹＰ６Ｙ２聚成一支，Ｂｏｏｔｓｔｒａｐ 值均大于９０％。替换率分析显示，中华按蚊ＡｓＣＹＰ６Ｙ１和ＡｓＣＹＰ６Ｙ２与其他３种按蚊同源基因的Ｋａ／Ｋｓ均小于１。 相对进化速率分析显示，中华按蚊ＣＹＰ６Ｙ和ＣＹＰ６Ｍ亚家族的相对进化速率均显著快于ＣＹＰ６Ｐ亚家族，而ＣＹＰ６Ｙ 和ＣＹＰ６Ｍ亚家族之间没有显著差异。【结论】在中华按蚊和达林按蚊中存在２个ＣＹＰ６Ｙ亚家族基因，之前在冈比 亚按蚊和不吉按蚊Ａｎ．ｆｕｎｅｓｔｕｓ中也发现２个 ＣＹＰ６Ｙ亚家族基因，表明ＣＹＰ６Ｙ亚家族基因可能在按蚊属广泛存 在，且可能为按蚊属昆虫所特有。 关键词：中华按蚊；ＣＹＰ６Ｙ亚家族；基因序列；生物信息学分析；基因结构；相对进化速率 中图分类号：Ｑ９６６　　文献标识码：Ａ　　文章编号：０４５４６２９６（２０１４）０６６６３１０ Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆｇｅｎｅｓｏｆｔｈｅＣＹＰ６Ｙ ｓｕｂｆａｍｉｌｙｉｎＡｎｏｐｈｅｌｅｓｓｉｎｅｎｓｉｓ（Ｄｉｐｔｅｒａ：Ｃｕｌｉｃｉｄａｅ）  ＴＡＮＧＹａｏ，ＱＩＡＯＬｉａｎｇ，ＺＨＡＮＧＹｕＪｕａｎ，ＣＨＥＹａｎＦｅｉ，ＨＯＮＧＲｕｉ，ＣＨＥＮＢｉｎ （Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆ ＥｎｔｏｍｏｌｏｇｙａｎｄＭｏｌｅｃｕｌａｒＢｉｏｌｏｇｙ，ＣｈｏｎｇｑｉｎｇＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＡｎｉｍａｌＢｉｏｌｏｇｙ，ＣｈｏｎｇｑｉｎｇＮｏｒｍａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｃｈｏｎｇｑｉｎｇ４０１３３１，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：【Ａｉｍ】ＴｏｉｄｅｎｔｉｆｙｇｅｎｅｓｏｆｔｈｅＣＹＰ６ＹｓｕｂｆａｍｉｌｙｉｎＡｎｏｐｈｅｌｅｓｓｉｎｅｎｓｉｓ，ａｎａｌｙｚｅｔｈｅｉｒｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ，ａｎｄｄｅｄｕｃｅｔｈｅｉｒｐｏｓｓｉｂｌｅｆｕｎｃｔｉｏｎｓ．【Ｍｅｔｈｏｄ】ＴｈｅＣＹＰ６ＹｓｃＤＮＡｔｒａｎｓｃ