菊分支NCED酶分子特征及进化分析.pdfVIP

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278 核 农 学 报 20 15 ,29 ( 2) : 0278 ~ 0289 Journal of Nuclear Agricultural Sciences 文章编号 : 1000 -855 1( 20 15) 02 -0278-12 菊分支 NCED 酶分子特征及进化分析 韦艳萍1 ,2 刘云飞1 许桂梅3 万红建1 李 志邈1 叶青静1 王荣青1 阮美颖1 姚祝平1 周国 治1 杨 悦俭1 ( 1 , , 3 100 12 ; 2 , , 2 10095 ; 3 , 20 1499) 浙 江省农 业 科学 院蔬菜研究 所 浙 江 杭州 南 京农 业 大学 江苏 南 京 上 海 华 维 节 水 灌 溉 有限 公司 上 海 : 9 - - ( NCED) , 摘 要 为探 究 顺 式 环 氧 类 胡 萝 卜 素 双 加 氧 酶 基 因 家 族 进 化 特 性 本 文 利 用 生 物 信 息 学 方 , ( 、 、 、 、 ) NCED 法 对 菊分 支类群 已完成 测序 的植 物 包括番茄 马铃薯 烟草 甜 菜 猴 面花 基于全基因 组进行 , , , 。 , 基因家族 鉴定 并 对 其 蛋 白 序 列 特 征 保 守基 序 次 级 结 构 以及 系统 发 育 关 系进 行 分 析 结 果 表 明 NCED , 2 ~ 4 。 505 ~ 652 aa , 酶是 由小基因家族编码 的酶 其成 员为 个 蛋白质氨基 酸 大 小在 之 间 分子质 56. 23 ~ 7 1. 42 kDa , SlNCED6 , , 量为 除 外 其余 各蛋白的 等 电点均表 现 为酸性 保 守基序 分析发 现 各 成 员 10 , 29 ~ 50 。 ,NCEDs , 均 包含 个保 守基序 其 长度在 之 间 此 外 蛋白结 构 分析 显 示 一 级 结 构氨基 酸序 列 N ,

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