马铃薯基因组中Dof转录因子家族的鉴定与表达特征分析.pdfVIP

员圆远园 核农学报摇 圆园员缘袁圆怨渊苑冤院员圆远园耀员圆苑园 允燥怎则灶葬造燥枣晕怎糟造藻葬则粤早则蚤糟怎造贼怎则葬造杂糟蚤藻灶糟藻泽 文章编号院员园园园鄄愿缘缘员渊圆园员缘冤园苑鄄员圆远园鄄员员 马铃薯基因组中阅燥枣转录因子家族的 鉴定与表达特征分析 吴智明摇 张圣旭摇 梁关生 渊仲恺农业工程学院园艺园林学院袁广东广州摇 缘员园圆圆缘冤 摘摇 要院阅燥枣渊阅晕粤鄄遭蚤灶凿蚤灶早憎蚤贼澡燥灶藻扎蚤灶糟枣蚤灶早藻则冤锌指蛋白是植物特有的一类转录因子袁在多种代谢途径中发 挥着重要作用遥 为全面了解阅燥枣基因在马铃薯基因组中的特征袁利用生物信息学方法鉴定出了马铃薯阅燥枣 基因家族成员袁并对基因的结构尧染色体定位尧系统进化关系和保守结构域进行了预测袁分析了阅燥枣基因在 不同组织和系列胁迫下的表达特征遥 结果表明袁马铃薯阅燥枣转录因子家族由猿缘 个基因编码源猿 个蛋白质曰 基因分布于除苑号和员圆号染色体外的其余员园条染色体上曰杂栽阅韵云蛋白长度在 员远缘耀缘园猿个氨基酸之间袁 等电点介于源郾苑圆耀员园郾园源曰系统发生分析表明袁杂栽阅韵云蛋白分为源 个亚族曰转录组数据分析显示袁杂贼阅燥枣基因 的表达具有组织特异性袁在不同胁迫条件下袁多数杂贼阅燥枣基因的表达也呈现有不同程度的差异遥 本研究为 深入探讨杂贼阅燥枣基因的功能及在马铃薯的遗传改良中的应用奠定了基础遥 关键词院马铃薯曰阅燥枣转录因子曰生物信息学曰基因表达 阅韵陨院员园郾员员愿远怨辕躁援蚤泽泽灶援员园园鄄愿缘缘员郾圆园员缘郾园苑援员圆远园 摇 摇 阅燥枣转录因子是锌指蛋白渊扎蚤灶糟枣蚤灶早藻则责则燥贼藻蚤灶泽冤家 控马铃薯块茎的形成过程中发挥着非常重要的作 族的一个亚家族袁是植物特有的一类转录因子遥 阅韵云 用遥 蛋白通常包含圆 个主要结构域院位于 晕 末端尧极端保 马铃薯渊杂燥造葬灶怎皂贼怎遭藻则燥泽怎皂 蕴援冤是全球第三大重 守的阅晕粤 结合结构域和位于 悦 末端尧氨基酸序列多 要的粮食作物遥圆园员员年袁马铃薯基因组测序的完成袁 变的转录调控结构域遥 晕 端保守结构域渊通常又称 为从基因组整体水平上全面分析某一基因家族袁并更 悦 悦 原阅燥枣结构域冤中包含员个 悦载 悦载 悦载 悦 基序形 好地应用于马铃薯遗传改良提供了基础咱圆圆暂遥 迄今为 圆 圆 圆 圆员 圆 成的单锌指结构袁此单锌指结构中 员个 在灶圆垣 与源 个 止袁马铃薯全基因水平上晕月杂鄄蕴砸砸抗病基因家族咱圆猿暂 悦赠泽残基共价结合袁形成蛋白质活性中心咱员暂遥 到目前 咱圆源暂 和 晕粤悦 家族 基因已先后被鉴定出来袁而关于 阅燥枣 咱圆暂 咱圆暂 咱猿暂 咱源暂 为止袁人们先后从拟南芥 尧水稻 尧杨树 尧大豆 尧 家族的报道较少遥 本研究以马铃薯基因组为数据来 咱缘暂 咱远暂 咱苑暂 咱愿暂 小麦 尧高粱 尧二穗短柄草 和番茄 等多种植物 源袁利用生物信息学方法从全基因组水平上鉴别 阅燥枣 基因组中分别鉴定出猿远尧猿园尧源员尧圆愿尧猿员尧圆愿尧圆苑 和猿源个 转录因子基因家族袁通过对所有成员的结构分析尧染色 阅燥枣基因遥 体定位尧保守结构域分析尧系统进化和时空表达特征等 现有研究表明袁阅燥枣转录因子在植物生长发育过 进行分析袁为更深入开展马铃薯 阅燥枣转录因子基因家 程中发挥重要作用袁并参与植物体内多种基因的表