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第二章基因工程制药1.ppt
2.pUC质粒载体 pUC载体是在pBR322质粒载体的基础上,组入了一个在其5,端带有一段多克隆位点的lacZ基因,而发展成为具有双功能检测特性的新型质粒载体系列。 (1)来自pBR322质粒的复制起点(ori); (2)氨苄青霉素抗性基因(ampr),但它的DNA核苷酸序列已经发生了变化,不再含有原来的核酸内切限制酶的单识别位点; (3) 大肠杆菌β-半乳糖酶基因(lacZ)的启动子及其编码α-肽链的DNA序列,此结构特称为lacZ基因; (4)位于lacZ基因中的靠近5”端的一段多克隆位点(MCS ,multiple cloning sites)区,但它并不破坏该基因的功能(图)。 (2) pUC质粒载体的优点 与pBR322质粒载体相比,pUC质粒载体系列具有许多方面的优越性,是目前基因工程研究中最通用的大肠杆菌克隆载体之一。其优点概括起来有如下三个方面: 第一、? 具有更小的分子量和更高的拷贝数? 第二,适用于组织化学方法检测重组体 第三,具有多克隆位点MCS区 Ampr ori pUC18 (3 kb) MCS (Multiple cloning sites, 多克隆位点) Lac promoter lacZ’ …ACGAATTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCA… . T h rA s n S er S e r Val Pro Gly Asp Pro Leu Glu Ser Thr Cys Arg His Ala Ser… EcoRI SacI KpnI SmaI XmaI BamHI XbaI SalI HincII AccI PstI SphI Lac Z The ORF of the inserted gene has to be in the same direction as that of the lacZ A fusion protein contains the N-terminal sequence of lacZ and the inserted ORF will be produced 噬菌体载体 插入型载体:只具有一个限制酶位点可便于外源DNA插入的载体.λgt10、 λgt11 用于克隆〈10kb的外源DNA,cDNA及小片段DNA 取代型载体:含有二个限制酶切点,在两个位点之间的DNA区段可以被外源DNA片段所取代的载体。 λEMBL 克隆真核生物染色体DNA 随着体外包装技术和寡聚核苷酸合成技术的发展,人们已经构建了许多带有多克隆位点的λ噬菌体载体,现在常规使用的λ噬菌体载体,不少既可用作插入型又可用作置换型。总之,多克隆位点的引入不仅极大地扩展了λ噬菌体的克隆范围,同时还大大地简化了其操作技术。 5、将重组体导入host cell 6、cDNA library identification 7、目的cDNA 克隆的分离和鉴定 (限制酶图谱的绘制、杂交分析、基因定位、基因测序、确定基因的 转录方向、转录起始点等。) cDNA文库的筛选 同源探针: - 表达基因差异显示技术设计的探针:DDRT-PCR 反向引物为5’-oligo(dT)MN-3’引物(M, dA/dG/dC; N, dA/dG/dT/dC正向引物为随即核甘酸序列 - 利用已知基因的同源序列设计的探针: 特异性抗体筛选 噬菌体表面展示技术 酵母双杂交技术 酵母单杂交系统 cDNA文库的建立过程 AAAAAAA TTTTTTTT RNA提取 分离mRNA Oligo dT或随机引物合成cDNA第一链 合成cDNA第二链 补平cDNA链末端 连接接头 连接噬菌体载体 包装噬菌体 感染、裂解宿主细胞 参数测定 分装、保存 转化或感染宿主菌 培养分离,形成菌斑或噬斑。 (文库所形成的噬斑实际上要密得多) 利用文库克隆目的基因 文库铺皿培养 形成噬斑 转膜 核酸杂交或抗体反应 获得阳性克隆 *核酸杂交适用于已知部分序列的目的基因克隆。*抗体反应适用于未知序列的但已经获得相应抗体的目的基因克隆。 放射性探针进行得第一轮筛库 在对应的培养皿上挑出相应的噬斑 扩大培养 由于挑出的噬斑不能保证是单个噬斑,所以必须 进行第二轮筛库第二次的铺皿密度要小得多,以保证能够获得单斑 在对应的培养皿上挑出相应的噬斑 RTPCR法: mRNA经反转录合成cDNA第一链,然后在特异性引物协助下,用PCR进行扩增,特异的合成目的cDNA 链。 对已发现基因的改造 通过对基因的功能相关区域研究,并采用基因修饰技术和点突变技术进行基因新功
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