北太平洋柔鱼微卫星标记的筛选及遗传多样性.pdfVIP

第 34 卷第 23期 生 态 学 报 Vol.34,No.23 2014年12月 ACTA ECOLOGICA SINICA Dec.,2014 DOI:10.5846/ stxb201303030334 刘连为,陈新军,许强华,李伟文.北太平洋柔鱼微卫星标记的筛选及遗传多样性.生态学报,2014,34(23):6847鄄6854. Liu L W,Chen X J,Xu Q H,Li W W.Isolation and genetic diversity of microsatellite DNA of Ommastrephes bartramii in the North Pcific Ocean.Acta Ecologica Sinica,2014,34(23):6847鄄6854. 北太平洋柔鱼微卫星标记的筛选及遗传多样性 1 1,2,3,* 1,2,3 1 刘连为 ,陈新军 ,许强华 ,李伟文 (1. 上海海洋大学海洋科学学院,上海摇 201306;2. 国家远洋渔业工程技术研究中心,上海摇 201306; 3. 上海海洋大学大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室,上海摇 201306) 摘要:采用(AC) 、(AG) 两种生物素探针,通过磁珠富集法构建了柔鱼部分基因组微卫星富集文库。 68个阳性克隆中有60 12 12 个含有微卫星序列,重复次数在 10次以上的占86.84%,最高重复次数为33次。 其中,完美型微卫星占60.53%,非完美型微卫 星占36.84%,混合型微卫星占2.63%。 除探针使用的AC/ TG、AG/ TC重复外,还得到ACAG、AGAC重复序列。 利用筛选出的8 个微卫星位点对北太平洋柔鱼6个群体的遗传多样性及遗传结构进行分析。 结果表明,8个微卫星位点均为高度多态性位点 = (PIC 0.787—0.987),位点Bo103与位点Bo105极显著偏离Hardy鄄Weinberg平衡(P0.01)。 6个地理位置的柔鱼群体显示出 = = 较高的遗传多样性水平(H 0.672—0.761,H 0.808—0郾851)。 两两群体间的F 值以及AMOVA分析结果均表明,群体间遗 o e st = 传分化不显著(F 0郾00559,P0郾05),遗传差异主要来自于个体间。 基于Nei忆s遗传距离的UPGMA 聚类树显示,北太平洋东 st 北部2个柔鱼群体(NE1、NE3)聚为一类,西北部 3个群体(NW1、NW2、NW3)与东北部 1个群体(NE2)另聚为一类,且群体 = NW1与群体NE2亲缘关系最近,遗传距离与地理距离线性相关分析没有呈现出正相关性(R 0郾175,P0郾05)。 遗传结构分析 结果推断北太平洋柔鱼存在 1个理论群。 柔鱼个体具有较强的游泳能力,在海流的作用下,群体之间存在较强的基因交流。 建 议今后在柔鱼资源开发利用过程中将北太平洋柔鱼看作 1个管理单元。 关键词:柔鱼;微卫星标记;遗传多样性;遗传结构 Isolation andgeneticdiversityofmicrosatelliteDNAof Ommastrephesbartramii in the North Pci