第三章兰州大学分子生物学生物信息的传递(上)从DNA到RNA.pptVIP

第三章 生物信息的传递（上）从DNA到RNA 六、内含子的剪接、编辑、再编码及化学修饰 断裂基因的发现 The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1993 断裂基因的外显子和内含子 真核基因的断裂结构 鸡卵清蛋白mRNA与其基因DNA杂交形成的异源双链产物的电镜照片 鸡卵清蛋白mRNA与DNA杂交形成的异源双链产物的模式图 内含子的特点 两种玉米乙醇脱氢酶内含子的比较 2. mRNA的剪接 脊椎动物前体mRNA内含子的典型结构 碱基字母表 Pre-mRNA剪接的两步转酯反应 证明剪切下来的内含子是套索结构的实验 剪接实验底物 电泳结果 内含子中分支点核苷酸的确定 酵母内含子中关键序列的证明 剪接体（splicesome）的组成 剪接体的组成 剪接体的组成 剪接体的组成 剪接体的组装与解体 U1 snRNA和U2 snRNA与前体mRNA序列之间的碱基配对 活性剪接体中RNA-RNA相互作用的骨架 活性剪接体中RNA-RNA相互作用的骨架 Commitment complex 的形成 synthetic lethal screen 寻找相关基因 BBP的发现 Synthetic lethal mutation screen 酵母菌落颜色的筛选原理 酵母菌落颜色的筛选原理 用酵母双杂交法分析BBP和其它蛋白质的相互作用 酵母和哺乳动物中内含子桥接蛋白质—蛋白质相互作用图示 质粒丢失率不同产生不同的菌落形态 酵母菌落的扇形表型 Pre-mRNA中的非GU-AG内含子 各种RNA前体的剪接 各种剪接类型的分布 反式剪接 反式剪接示意图 变位剪接 变位剪接的几种类型 降钙素及降钙素基因相关肽的合成 3. RNA的编辑、再编码及化学修饰 碱基转换 哺乳动物中载脂蛋白B mRNA的编辑 哺乳动物中RNA编辑的实例 锥虫线粒体coxⅡmRNA的编辑 gRNA指导的U插入 U 插入和删除的可能机制 RNA编辑的生物学意义 （2）RNA的再编码 （3）RNA的化学修饰 3. 核酶 A. 剪切型核酶 （1）锤头型核酶 锤头型核酶的基本结构及保守序列 锤头型核酶的各种设计 （2）发夹型核酶 发夹型核酶的基本结构 （3）蛋白质—RNA复合酶 B. 剪接型核酶 ade2的酵母突变株在菌体内积累红色中间产物，菌落显红色；ade2 ade3双突变的酵母菌落则呈白色，因为在腺嘌呤生化合成途径中，ADE3位于ADE2的上游，ADE3突变使得红色中间产物无法产生。当ade2 ade3突变株体内含有带ADE3基因的质粒，其菌落在选择性平板上则又显红色。在非选择性条件下，在细胞分裂期间质粒以低频率丢失，丢失质粒的那些细胞长成白色，所以菌落有白色的扇形（红白相间现象）。 经过物理或化学诱变处理，酵母菌可能有4种情况：①未发生突变，表型不变，菌落仍产生扇形现象；②发生了不影响生存的突变，菌落仍产生扇形现象；③发生了致死突变，不能形成菌落；④发生了与RBD-3合成致死的突变，在含有MUD2质粒的细胞中，长成红色。这是因为在少数丢失MUD2质粒的细胞中，新突变与RBD-3合成致死，细胞死亡（本来形成白色的那些菌死亡），所以菌落呈纯红色。 A.YRpU-ADE3 B.YCpU-ADE3 C.YCpU-ADE3-PGAL1 D.YCpU-ADE3-PGAL1 培养基中加半乳糖 25℃ 35℃ 野生型TOP2+ 温度敏感突变型top2-4 GU-AG introns comprise the vast majority (98% of splicing junctions in the human genome). 1% use the related junctions GC-AG. And then there is a minor class of introns marked by the ends AU-AC (comprising 0.1% of introns). The first of these introns to be discovered required an alternative splicing apparatus, called the U12 spliceosome, consisting of U11 and U12 (related to U1 and U2, respectively), a U5 variant, and the U4atac and U6atac snRNAs. The splicing reaction is essentially similar t