试验报告[青枯-2010-0914]第1页，共2页编号农业微生物研究中心[青.docVIP

编号：生物[青枯雷尔氏菌, 共14页 承担单位：福建省农科院农业生物资源研究所 试验设计： 试验项目：青枯雷尔氏菌16S rRNA的生物信息学分析 试验人员：唐唯其 试验负责： 报告日期：2010-09-20 计数月份：2010年09月 研究资格系数 (0.5-1.0) 实验设计系数 （0.9-1.0） 报告得分 总分 实验设计 实验记载 实验分析 实验简报 实验文章 1-20% 21-40% 41-60% 61-80% 81-100% 1%-5% 设计，实施实验，记载，分析清晰，结论清晰文献完整，发表水平 农业微生物研究中心 电话: 0591 传真: 0591 试验目的 分析多种青枯雷尔氏菌及其近缘物种的16S rRNA的系统发育树，包括新测序的青枯雷尔氏菌RS91和RS98，从而分析RS91和RS98与这些物种的亲缘性及分歧度。 实验内容 2.1 细菌基因组数据来源 在NCBI Taxonomy物种树中青枯雷尔氏菌属于Ralstonia属（Genus），Burkholderiaceae科（Family），在该Family下主要还有Cuprivavidus、Polynucleobacter及BurkholderiaBurkholderiaceae，只有Ralstonia、Cuprivavidus、Polynucleobacter及Burkholderia表1. Burkholderiaceae Genus Strain Organization ProjectID Ralstonia Ralstonia solanacearum GMI1000 Genoscope 13 Ralstonia solanacearum UW551 University of Florida 15061 Ralstonia solanacearum IPO1609 Genoscope 32087 Ralstonia solanacearum MolK2 Genoscope 32085 Ralstonia solanacearum PSI07 Genoscope 56083 Ralstonia solanacearum CFBP2957 Genoscope 50685 Ralstonia solanacearum CMR15 Genoscope 50681 Ralstonia pickettii 12D JGI 18937 Ralstonia pickettii 12J JGI 17631 Cupriavidus Cupriavidus necator（Ralstonia eutropha H16） Gottingen Genomics Laboratory 13603 Cupriavidus pinatubonensis （Ralstonia eutropha JMP134） JGI 10646 Cupriavidus metallidurans CH34 JGI 250 Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 Genescope 15733 Polynucleobacter Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1 JGI 16679 Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1 JGI 19991 Burkholderia Burkholderia ambifaria AMMD JGI 13490 Burkholderia ambifaria MC40-6 JGI 17411 Burkholderia cenocepacia AU 1054 JGI 13919 Burkholderia cenocepacia HI2424 JGI 13918 Burkholderia cenocepacia J2315 Sanger Institute 339 Burkholderia cenocepacia MC0-3 JGI 17929 Burkholderia mallei SAVP1 TIGR 13947 续表1. GenusStrain Organization ProjectID Burkholderia Burkholderia mallei NCTC 10247 TIGR 13946 Burkholderia mallei NCTC 10229 TIGR 13943 Burkholderia mallei ATCC 23344 TIGR 171 Burkholderia multivorans ATC