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- 2016-04-12 发布于安徽
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BLAST相似序列数据库搜索.doc
实习 4 ： BLAST相似序列的数据库搜索
学号 20090**** 姓名 ****** 专业年级 生命生技****
实验时间 2012.6.19 提交报告时间 2012.6.20
实验目的：
学习使用BLAST在数据库中搜索相似序列
实验内容：
使用NCBI上面的BLAST程序进行相似性序列搜索：
把核酸序列利用BLASTN搜索相似核酸序列；
把蛋白质序列对应的蛋白质利用BLASTP搜索相似蛋白质序列；
把核酸序列利用BLAST搜索相似蛋白质序列并与BLASTP比较，体会差异：
把蛋白质序列利用TBLASTN搜索相似核酸序列并与BLASTN比较，体会差异：
把核酸序列利用TBLASTX搜索相似核酸序列并与BLASTN比较，体会差异。
作业：
1. 找一条你感兴趣的核酸序列（可以是前面搜索到的同源核酸序列中任意一条），通过BLASTN搜索NR数据库，说明你的参数如何设置，分析搜索结果包含哪些信息。
答：使用的序列为：智人胰岛素（INS）gi|297374822|ref|NM_001185098.1| Homo sapiens insulin (INS), transcript variant 3, mRNA。
Algorithm parameters设置如下：
参数：
Enter Query Sequence——
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