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分子设计与组装 主要内容 第一章 概述 第二章 分子设计的基础 第三章 脂肪族衍生物的分子设计 第四章 芳香族衍生物的分子设计 第五章 聚合物的分子设计 第六章 分子组装 第一章 概述 有机化学的三个领域: 天然产物的分离、鉴定、结构测定 物理有机化学 有机合成 有机合成领域 分子设计与组装方法 依据: 分子的构效关系 功能来源于性质 性质决定于结构 进行分子设计前 ,首先确定构效关系 , 再根据所需的功能设计分子 不对称合成与不对称放大 反向分子设计 结构互补 神经网络法、 统计模式识别、 电子结构法 、催化剂——药物 基团贡献法 主要精细化工产品的性质与结构 表面活性剂 染料 农药 医药 香料 化妆品 功能高分子材料 药物分子设计 新药的寻找是一件耗资巨大而效率很低的工作。 研制一种新药: 平均需要花 10-12 年的时间, 筛选 1.5-2万种化合物, 耗资3.0-5.0 亿美元。 原因: 新药研究缺乏成熟的理论,新药的研制仍主要 依赖反复试验。 药物设计: 一个梦想,药物分子设计方法已经越来越成熟, 在许多药物 的研究中发挥开始重要的作用。 药物分子设计方法 直接药物设计: 从生物靶标大分子结构出发, 寻找、 设计能够与它发生相互作用 并调节其功能的小分子 间接药物设计: 从小分子结构出发, 通过改造、 修饰等方法得到活性更好、 毒性更 低的新化合物 间接药物分子设计 定量构效关系: 在药物和农药研究中起着重要的作用。 假设: 研究的分子结合在同一个靶标生物大分子的相同部位 传统的定量构效关系: 利用分子和基团的物理化学性质作为结构参数。 缺乏实验数据而无法应用 二维定量构效关系: 基础:分子拓扑连接性质基础 容易获取参数; 不存在三维定量构效关系方法中的构象问题, 目前研究药物 吸收、 分布等性质常见的方法。 间接药物分子设计 三维定量构效关系方法: 小分子三维结构 预测小分子与生物大分子 三维定量构效关系研究的方法, 在药物研究中已经越来越广泛地应用。 较重要的方法有: 距离几何 比较分子力场分析 比较分子相似性指数分析 。 比较分子力场分析 应用最广, 它采用化合物周围的静电场、 范 德华力场等的空间分布作为化合物结构描述变量, 通过最小二乘法建立化合物的生物活性与化合物 周围各种力场空间分布之间关系的模型。 显示出应当如何进行结构的改造 提高化合物的生物活性。 直接药物分子设计 分子对
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