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- 2016-04-19 发布于湖北
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KEGG,Kyoto encyclopedia of Genes and Genomes ,不多说。目录2楼---KEGG的数据3楼---看KEGG代谢通路图4楼---KEGG的自动注释5楼---代谢通路的着色6楼---芯片数据的分析7楼---KGML与通路编辑8楼---总结欢迎大家交流小木虫图片上传慢的要死!!!!!:sweat: 只能先上传到其他地方在贴过来了!!!补充:? ? 这个帖子写的早了,平日比较忙没有更新。后来发现图不能打开了,又不能原帖编辑,因此重新上图附于每楼。? ? KEGG应该也在不断更新,若有不同之处请见谅。欢迎大家交流!
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看天 (站内联系TA)
KEGG中的pathway是根据相关知识手绘的,这里的手绘的意思可能是指人工以特定的语言格式来确定通路各组件的联系;基因组信息主要是从NCBI等数据库中得到的,除了有完整的基因序列外,还有没完成的草图;另外 KEGG中有一个“专有名词”KO(KEGG Orthology),它是蛋白质(酶)的一个分类体系,序列高度相似,并且在同一条通路上有相似功能的蛋白质被归为一组,然后打上KO(或K)标签。下面就首先来讲一下KEGG??orthology。? ? 任找一个代谢通路图,在上方有pathway meue | payhway entry | Show(Hide) descri
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