生物化学第3章氨基酸解读.pptVIP

侧链R基参与的反应: 酪氨酸 碱性氨基酸 半胱氨酸 用于蛋白质的化学修饰 功能团有：羟基、酚基、巯基、吲哚基、咪唑基、胍基、甲硫基、 非α-氨基和非α-羧基等。 酪氨酸侧链反应——酚基碘化或硝化 Pauly反应 这些反应可用于巯基的保护；可用于检测蛋白中的半胱氨酸残基； 把其他分子与目标多肽、蛋白进行偶联 半胱氨酸侧链巯基的反应:烷基化 二硫键 与金属离子的螯合性质可用于体内解毒。 二硫键对维持蛋白结构很重要，氧化剂和还原剂都可打开二硫键，最常用还原剂β-巯基乙醇和二硫苏糖醇 半胱氨酸侧链巯基的反应 （p142）: 五、氨基酸的分离分析 分配柱层析：支持剂是一些具有亲水性的不溶性物质，如纤维素、淀粉、硅胶等。 滤纸层析： 薄层层析： 离子交换层析：阴离子交换树脂-N(CH3)3OH或-NH3OH，阳离子交换树脂-SO3H 支持物不同 最常用：高效液相色谱 （HPLC）、气相色谱(GC) 纸层析 把支持剂涂布在玻璃板上使成为一个均匀的薄层 薄层层析 离子交换层析 /view/e845c4c8a1c7aa00b52acb47.html /view/e845c4c8a1c7aa00b52acb47.html 用强酸型阳离子交换树脂分离氨基酸 氨基酸与树脂的亲和力取决于： 气液层析 高效液相层析 蛋白质的水解条件及优缺点 高碘酸及其盐可以定量的氧化断裂邻二羟基、α-羟基醛等的碳碳键，产生相应的羰基化合物。该反应可以用来区分糖苷是呋喃还是吡喃型的。侧翼测定直连多糖的相对分子量和支链淀粉的非还原末端残基数，即分支数目。 第一章糖课后题 第6题 糖原分子量 糖原中葡萄糖残基的相对分子质量为180-18（水的相对分子质量）=162 一分子非还原末端的葡萄糖残基被高碘酸钾氢化生成一分子的甲酸，因此，500mg糖原中非还原性末端残基的摩尔质量分数与新生成的甲酸的摩尔质量分数相等。 n个分支点含有n+1个残基间的差别可忽略，所以可假设分支点的物质的量=非还原端物质的量。 非还原端末端残基的质量数为：0.347mmol×162(mg/mmol)=56.214mg， 因此，出现在1-6分支点上葡萄糖残基的百分数为：(56.214/500)×100%=11.24% 生物化学 第三章 氨基酸 (amino acid) 一、氨基酸——蛋白质的构件分子 氨基酸(amino acid) ：α-氨基酸是一切蛋白质的组成单位。氨基酸是与羧酸相邻α-碳原子上连有一个氨基，故称α-氨基酸。 利用酸水解、碱水解、酶解可把蛋白质分子水解释放氨基酸。 L型 α-氨基酸 不变部分（除脯氨酸） 可变部分 180多种天然氨基酸； 20种蛋白质氨基酸 氨基酸首尾脱水聚合成肽键。 各种氨基酸的区别在于侧链R基的不同 20种蛋白质氨基酸按R的极性可分为非极性氨基酸、不带电荷极性氨基酸、带正电R基氨基酸和带负电R基氨基酸 按R基的结构可分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸及杂环氨基酸3大类 除甘氨酸外，氨基酸均含有一个手性?-碳原子，因此都具有旋光性。 氨基酸的名称常用三个字母的缩写，或单个字母表示长的肽链。 二、氨基酸的分类、性质 氨基酸 脂肪族 氨基酸 芳香族氨基酸 杂环氨基酸 一氨基一羧基（中性氨基酸） Gly、Ala、Val、Lue、Ile、Ser、Thr、Cys、Met 一氨基二羧基（酸性氨基酸）及其酰胺 Asp、Asn、Glu、Gln 二氨基一羧基（碱性氨基酸） Arg、Lys Phe、Tyr、Trp His、Pro 2.1氨基酸的分类——按照R化学结构分类 甘氨酸 丙氨酸 缬氨酸 亮氨酸 异亮氨酸 脂肪族氨基酸：一氨基一羧基（中性氨基酸） 脂肪族氨基酸：一氨基一羧基（中性氨基酸）:含有羟基 丝氨酸Ser的-OH在生理条件下不解离，但是个极性基团，能与其他基团形成氢键，常出现在酶的活性中心； 苏氨酸Thr的-OH是仲醇，具有亲水性； 脂肪族氨基酸：一氨基一羧基（中性氨基酸）:含有硫 Methionine (Met，M) Cysteine (Cys，C) 两个半胱氨酸的巯基氧化生成二硫键，生成胱氨酸，Cys-S-S-Cys 蛋氨酸的甲硫基的硫原子有亲核性，容易发生极化，在生物合成中是重要的甲基供体 脂肪族氨基酸：一氨基二羧基（酸性氨基酸） 天冬氨酸 谷氨酸 天冬酰胺 谷氨酰胺 脂肪族氨基酸：二氨基一羧基（碱性氨基酸） 赖氨酸Lys侧链氨基生理条件下带有一个正电荷 精氨酸Arg是碱性最强的氨基酸，侧链的胍基pKa=12.48，生理条件下完全质子化 组氨酸His含有咪唑环，是20种氨基酸中侧链pK值最接近pH的一种，生理pH条件下具有缓冲能力的一种氨基酸。 芳香族氨基酸 苯丙氨酸 酪氨酸