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(三)?-折叠 ①多肽链充分伸展,相邻肽单元之间折叠成锯齿状结构,侧链位于锯齿结构的上下方。 ②两段以上的β -折叠结构平行排列 ,两链间可顺向平行,也可反向平行 。 ③两链间的肽键之间形成氢键,以稳固β -折叠结构。氢键与螺旋长轴垂直。 (四)?-转角和无规卷曲 ?-转角: 无规卷曲:没有确定规律性的肽链结构。 ① 肽链内形成180o回折。 ②含4个氨基酸残基,第一个氨基酸残基与第四个形成氢键。 ③ 第二个氨基酸残基常为Pro。 ?-转角: (五)模体 蛋白质分子中,二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个具有特殊功能的空间构象,被称为模体(motif)。 螺旋-环-螺旋 锌指 (六)影响二级结构形成的因素 氨基酸侧链所带电荷 、大小及形状。 影响α-螺旋形成的因素: β -折叠形成条件: 要求氨基酸侧链较小。 三、蛋白质的三级结构 疏水键、离子键、氢键和 Van der Waals力等。 稳定因素: 整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。 定义 肌红蛋白 (Mb) N 端 C端 纤连蛋白分子的结构域 结构域 (domain) 大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各行其功能,称为结构域。 结构域 Triose phosphate isomerase 亚基之间的结合力主要是氢键和离子键。 四、蛋白质的四级结构 蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。 每条具有完整三级结构的多肽链,称为亚基 (subunit)。 血红蛋白(Hb)的四级结构 (一)一级结构是空间构象的基础 蛋白质一级结构与功能的关系 牛核糖核酸酶的一级结构 二硫键 天然状态,有催化活性 尿素、β-巯基乙醇 去除尿素、 β-巯基乙醇 非折叠状态,无活性 (二)一级结构与功能的关系 例:镰刀形红细胞贫血 N-Val · His · Leu · Thr · Pro · Glu · Glu · · · · ·C(146) HbS β 肽链 HbA β 肽 链 N-Val · His · Leu · Thr · Pro · Val · Glu · · · · ·C(146) 这种由蛋白质分子发生变异所导致的疾病,称为“分子病”。 * 协同效应(cooperativity) 一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结合后,能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合能力的现象,称为协同效应。 促进作用称为正协同效应 (positive cooperativity) 抑制作用称为负协同效应 (negative cooperativity) 变构效应(allosteric effect) 凡蛋白质(或亚基)因与某小分子物质相互作用而发生构象变化,导致蛋白质(或亚基)功能的变化,称为蛋白质的变构效应。 蛋白质构象改变与疾病 蛋白质构象病:若蛋白质的折叠发生错误,尽管其一级结构不变,但蛋白质的构象发生改变,仍可影响其功能,严重时可导致疾病发生。 蛋白质构象病的机理:有些蛋白质错误折叠后相互聚集,常形成抗蛋白水解酶的淀粉样纤维沉淀,产生毒性而致病,表现为蛋白质淀粉样纤维沉淀的病理改变。 这类疾病包括:人纹状体脊髓变性病、老年痴呆症、亨停顿舞蹈病、疯牛病等。 疯牛病 疯牛病是由朊病毒蛋白(prion protein, PrP)引起的一组人和动物神经退行性病变。 正常的PrP富含α-螺旋,称为PrPc。PrPc在某种未知蛋白质的作用下可转变成全为β-折叠的PrPsc,从而致病。 PrPc α-螺旋 PrPsc β-折叠 正常 疯牛病 总结 人有了知识,就会具备各种分析能力, 明辨是非的能力。 所以我们要勤恳读书,广泛阅读, 古人说“书中自有黄金屋。 ”通过阅读科技书籍,我们能丰富知识, 培养逻辑思维能力; 通过阅读文学作品,我们能提高文学鉴赏水平, 培养文学情趣; 通过阅读报刊,我们能增长见识,扩大自己的知识面。 有许多书籍还能培养我们的道德情操, 给我们巨大的精神力量, 鼓舞我们前进。 * * 化学结构 发现途径 生物化学,细胞与分子生物学基础 计算机辅助药物设计 2 药物的化学结构 键能:凡形成一个新键或打断一个旧键所释放或所吸收的能量 键长:成键的两个原子核间的距离 键角:原子间形成共价键时键与键的夹角 常见共价键键能表如下图 常见共价键键长:过长或过短都将引起能量升高 常见共价键键角:若键角发生扭曲使体系能量升高 药物发现途径 偶然发现:英国细菌学家弗莱明发现青霉素,于1945年共同获得诺贝尔医学和生理学奖 定向筛选:设计
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