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高级生物化学
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1举例说明别构酶的调节(举例说明酶活性的调节)
别构酶是寡聚酶,含两个或两个以上亚基,有多个底物结合部位(活性中心)和效应剂结合部位(调节中心)。活性中心负责与底物结合与催化,调节中心负责调节酶的反应速度。能调节酶活性的有别构激活剂和别构抑制剂。
正协同:E.coli天冬氨酸转氨甲酰酶(ATCase)的别构调节效应。这种酶分子由6个催化亚基和6个调节亚基组成。它的作用底物是天冬氨酸(Asp)和氨甲酰磷酸。在饱和氨甲酰磷酸存在下,ATCase的活性受ASP浓度调控:v-[Asp]作图为S型。当加入别构激活剂ATP时,曲线左移,随着Asp浓度的增大渐趋于双曲线。并且控制酶活性底物的分子开关向浓度小的方向移动,而且范围变窄;加入别构抑制剂CTP时,曲线右移,S曲线明显,分子开关向浓度大的方向移动。
负协同:3-磷酸甘油醛脱氢酶(3-PDG)催化糖酵解中唯一的脱氢反应,是负协同别构酶的代表。兔肌3-PDG由4个亚基组成,理论上全酶可结合4分子NAD+,但结合的亲和力不同,实际上通常只能结合2分子NAD+。即酶分子上只有一半NAD+结合位点被NAD+占据。这是一种极端的负协同效应,当第一和第二个NAD+与酶的两个亚基结合后,由于别构效应,是的另外两个亚基对NAD+的亲和力下降2~3个数量级,说明在一定的底物浓度范围内,酶活性不受底物浓度变化的影响,这是另一种意义上的调节。
2.蛋白质的翻译后修饰有哪些类型?举例论述两种蛋白质的共价修饰。
新生多肽链多数都需经过翻译后修饰才会转变为成熟的蛋白质。许多蛋白质要分别经过甲基化、羟基化、糖基化、泛肽化、羧基化、磷酸化、乙酰化、脂酰化和异戊烯基化。例如蛋白质的泛肽化、蛋白质的可逆磷酸化等。
蛋白质的泛肽化:蛋白酶体对蛋白质的降解通过泛素介导,所以又称为泛素降解途径。泛素介导的过程被称为泛素化。蛋白酶体对蛋白质的降解作用分为两个过程:一是对被降解的蛋白质进行标记,由泛素完成;二是蛋白酶解作用,由蛋白酶体催化。蛋白酶体存在于所有真核细胞中,其活性受γ干扰素的调节。
泛素化是对特异的靶蛋白进行泛素修饰的过程。一些特殊的酶将细胞内的蛋白分类,从中选出靶蛋白分子。泛素化修饰涉及泛素激活酶E1、泛素结合酶E2和泛素连接酶E3的一系列反应:首先在ATP供能的情况下酶E1粘附在泛素分子尾部的Cys残基上激活泛素,接着,E1将激活的泛素分子转移到E2酶上,随后,E2酶和一些种类不同的E3酶共同识别靶蛋白,对其进行泛素化修饰。根据E3与靶蛋白的相对比例可以将靶蛋白单泛素化修饰和多聚泛素化修饰。E3酶的外形就像一个夹子,靶蛋白连接在中间的空隙内。酶的左侧结构域决定靶蛋白的特异性识别,右侧结构域定位E2酶以转移泛素分子。
蛋白质的可逆磷酸化:蛋白质可逆磷酸化修饰是调控各种各样生物学功能的通用机制。其后,人们陆续发现了许多受这种方式调控的生理生化过程,如基因的复制和转录,分子识别和信号转导,蛋白质的合成与降解,物质代谢与跨膜运输,细胞形态建成与肌肉收缩,细胞周期的运转,细胞增殖与分化等等。实际上,蛋白质的可逆磷酸化是许多信号转导途径实现其生物学功能的枢纽。
可逆磷酸化作用调节蛋白质活性的机制:通过可逆磷酸化向蛋白质大分子中引入或去掉一个或不多几个共价结合的磷酸基,可使其生物学活性发生戏剧性的转变,二者之间的关系可以归纳为以下几种:
A.单一部位磷酸化导致单一功能的变化,如肝细胞糖原磷酸化酶中Ser14被磷酸化之后即可从钝化状态变成活化构象,催化糖原的磷酸解。
B.多部位磷酸化导致单一功能的变化,肝细胞中的糖原合酶Ser7和Ser10分别被AMPK和PKA磷酸化而钝化。
C.多部位磷酸化分别导致不同功能的变化,如转录因子STAT1的单体为钝化状态,当被受体结合的JAK将其Tyr701磷酸化后,有了二聚化和核转位的能力,再经一种MAPK将其Ser727磷酸化,才会充分活化,刺激靶基因的转录。
D.单一部位磷酸化导致多个不同功能的变化,如肝细胞中的果糖6-磷酸激酶-2/果糖2,6-二磷酸酶,Ser32的磷酸化导致激酶活性的钝化和磷酶酶活性的活化。
试述蛋白质泛素化修饰的反应历程及其生物学意义。
真核细胞中,细胞溶胶和细胞核内多数蛋白由泛肽-26S蛋白酶体途径降解。泛肽是一种高度保守的小蛋白,主要定位于细胞溶胶和细胞核,在一系列酶的作用下与靶蛋白共价连接。多泛肽化的靶蛋白可被26S蛋白酶体识别并迅速降解。 泛肽途径涉及到的酶有泛肽活化酶(E1)、泛肽载体蛋白(E2)、泛肽-蛋白连接酶(E3)和26S蛋白酶体。通常只有一种E1,催化泛肽的活化。而E2和E3却存在很多种,尤其是E3,主要负责泛肽同蛋白质结合的选择性和降解的专一性,不同的靶蛋白由不同的E3来识别。26S蛋白酶体由至少30多种不同的亚基组成,包
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