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实验二、常用分子生物学数据库的使用及搜索
由/BLAST/ 进入
一、进入nucleotide blast
操作如下：
输入序列
Database选择nucleotide collection（nr/nt）
Program selection选择 blastn
点击 blast
序列：gi|568815579:39243632 Homo sapiens chromosome 19, GRCh38 Primary Assembly
ATGAAACTAGGTGAGTCCCACATCTCTGTCCGTGCTCAGCTCCTGCAGCCCCTGCCCTCAGTGGGCAGCC
TCTGCATTCCCTCAGCTCCCTTTCTCTCTGTGACACAGACATGACCGGGGACTGCATGCCAGTGCTGGTG
CTGATGGCCGCAGTGCTGACCGTGACTGGAGCAGTTCCTGTCGCCAGGCTCCGCGGGGCTCTCCCGGATG
CAAGGGGCTGCCACATAGCCCAGTTCAAGTCCCTGTCTCCACAGGAGCTGCAGGCCTTTAAGAGGGCCAA
AGATGCCTTAGTGAGTCTCCCCCTGCCCTCCTGCCATGGACTAGCCTCCACCCGCACTCCAAGGGTCACC
ATGCTTTCCCACTCCCAGCTTCCTTCACTGGGCTAGCCTCCACCCTCCCTGCAGTGGGCTATCTCATGCT
CCTACTGCAGGGACTGACTCATGTTTTCCTGAAGAAGAGGGTCCTCTACCATCCTCCCAGCAGTTAACCT
CCCCTATCCTGTTGTCAGCCATCCTCCAATCCCATCAGAGTGGTCTAACCTCCACCCCTCCTGCTGGGGC
TAACCTGTGCCTTTGCTGTCTAGGAAGAGTCGCTTCTGCTGAAGGACTGCAAGTGCCGCTCCCGCCTCTT
CCCCAGGACCTGGGACCTGAGGCAGCTGCAGGTGAGAGGGGGAGTCAGGCCCACCCCTGCCCTCCCAGCC
CTGCTCACCTGGCTCTGTAGTGGCCCCTTCACCTTCTCCTTCTCCATTGTCCCTCTCTCCTCTCCCCACA
CCTGCTACCCCTTCCCTCTGCTCCTACCTGACCACACTGGCTGTGCCCTCTCCCCTGTGCCTGTCACCTT
CACTTGTTCCTCTCTATCCTCCTCCCCCAACCTGTTCCCCTCACCTCCCCCCTCACCTGCTCTTTCTCAC
CTCTCCTCAGGTGAGGGAGCGCCCCGTGGCTTTGGAGGCTGAGCTGGCCCTGACGCTGAAGGTTCTGGAG
GCCACCGCTGACACTGACCCAGCCCTGGGGGATGTCTTGGACCAGCCCCTTCACACCCTGCACCATATCC
TCTCCCAGCTCCGGGCCTGTGTGAGTCGTCAGGGCCCGGGCACCCAGGTCTGTGAGCTCTGAGCAGCGTC
CTTCCCCTGGCCAAGGCCCCGGCTCACACACCGCCCTCCTCTGCCCACAGATCCAGCCTCAGCCCACGGC
AGGGCCCAGGACCCGGGGCCGCCTCCACCATTGGCTGCACCGGCTCCAGGAGGCCCCAAAAAAGGTGAGT
GACCCGGGAAGAGAGGGACTGAGGTCTGGGGAGCCACTGGGAGCCCAGAACCCAGACAGCCCCTGACCCA
TCCCCTCCTCCCTACAGGAGTCCCCTGGCTGCCTCGAGGCCTCTGTCACCTTCAACCTCTTCCGCCTCCT
CACGCGAGACCTGAATTGTGTTGCCAGCGGGGACCTGTGTGTCTGA
Program selection选择 blastn
点击 blast
结果：输入序列的信息以及graphic summary，descriptions，alignments三部分
Alignment：Homo sapiens interleukin 28A gene, complete cds与输入序列比对
进入protein blast
操作：输入序列
gi|677991589|sp|B4ER10.1|IFNL3_CHICK RecName: Full=Interferon lambda-3; Short=IFN-lambda-3; AltName: Full=Interleukin-28B; S
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