化学诱导后白木香转录组文库的构建及测序.pdfVIP

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2016-11-15 发布于安徽
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化学诱导后白木香转录组文库的构建及测序.pdf

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生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 年第期 2013 8 化学诱导后白木香转录组文库的构建与测序 1，2 1 1 3 2 1 吴宏清王磊陶美华高晓霞白玲章卫民（1. 广东省微生物研究所广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东省华南应用微生物重点实验室 -省部共建国家重点实验室培育基地，广州 510070 ；2. 江西农业大学理学院，南昌 330045 ；3. 广东药学院，广州 510006）摘要：采用改良异硫氰酸胍-CTAB 法对5 年生白木香树干经化学诱导后 1 年的各部分组织进行总RNA 提取，提取到的总RNA 经富集mRNA 、打断、构建测序用cDNA 文库后用于转录组测序，测序质量较高，Q20 高达97.45% ，共获得54 685 634 条 Clean reads ，总测序长度达4 921 707 060 nt ，经初步组装，获得 190 109 条Contigs 序列，进一步组装，获得83 467 条Unigenes 序列，总长度为58 569 625 nt ，平均长度为702 nt ，N50 值高达1 120 ，大于等于3 000 nt 的Unigenes 有1 691 条，占总Unigenes 的2.03% ，组装质量较高，使白木香的转录组信息得到较好的保存，为进行白木香结香相关的表达谱分析奠定基础。关键词：白木香化学诱导转录组文库测序组装 Unigenes Transcriptome Library Construction and Sequencing from Chemically Induced Aquilaria sinensis 1，2 1 1 3 2 1 Wu Hongqing Wang Lei Tao Meihua Gao Xiaoxia Bai Ling Zhang Weimin - （1. State Key Laboratory of App lied Microbiology Ministry Guangdong Province Jointly Breeding Base ，South China ，Guangdong Op en Laboratory of App lied Microbiology ，Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and App lication ，Guangdong Institute of Microbiology ，Guangzhou 510070 ；2. College of Science ，Jiangxi Agricultural University ，Nanchang 330045 ； 3. Guangdong Pharmaceutical University ，Guangzhou