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东海原甲藻增殖细胞核抗原基因表达量与生长关系的研究
摘 要
浮游藻是海洋食物链的重要一环,在能量转移和营养盐循环等方面起着重要
作用。对浮游藻现场生长率等基本生理生态学参数的测定,是估算浮游藻生产力、
研究浮游藻种群变迁、构建生态动力学模型乃至赤潮预测的基础,特别是现场测
定单种浮游藻的生长率显得尤为重要。但目前尚缺乏一种准确估算单一种类浮游
藻现场生长率的方法。近年来,国际上对细胞周期标志物的研究显示,增殖细胞
cellnuclear
核抗原(proliferatingantigen,PCNA)可能在浮游藻生长率研究中有巨
大的潜在应用价值,这为藻类生长率的估算提供了新的研究方向。
本研究以我国东海海域常见的赤潮藻——东海原甲藻(Prorocentrum
色素b基因的eDNA全长序列,分别设计了符合实时荧光定量PCR检测要求的
量PCR方法,系统研究了东海原甲藻PCNA基因表达量在不同细胞周期中的变
化及其与生长率之间的关系,为运用分子生物学技术实现东海原甲藻现场生长率
的估算奠定了基础。
’主要研究结果如下:
b)基因的cDNA全长序列,并分别对
b,Cyt
1124bp的细胞色素b(cytochrome
b进行了序列比对和系统进化树分析。
PCNA和Cyt
b基因序列,分别设计了符合实时荧光定量
(2)根据得到的PCNA与Cyt
GreenI
所设计PCNA基因的I讧Q.PCR引物的特异性进行了分析。采用SYBR
b基因的
染料和TaqMan探针两种荧光体系建立了检测东海原甲藻PCNA与Cyt
Green
I染料体系得到的曲线方程分
实时荧光定量PCR的标准曲线。采用SYBR
别为:对PCNA,Y=.3.403x+40.048,(r=0.999,其中X为细胞数对数值,Y
为CT值,r为相关系数);对Cyt
对Cyt
建立标准曲线的准确性。
。(3)运用建立的定量PCR方法,系统研究了东海原甲藻PCNA基因表达量
b基因表达
在不同细胞周期中的变化及其与生长率之间的关系。结果表明,Cyt
稳定j平均单细胞表达量为(45.4+4.7)拷贝,在不同的生长阶段表达量变化很小,
是一个潜在的良好的内参基因。与此不同,平均单细胞中PCNA表达量在培养
的不同阶段变化较大,指数期的含量比平台期高4倍左右,说明PCNA表达量
与细胞分裂密切相关。以Cytb基因为内参基因,PCNA基因为目的基因,进一
步研究了不同培养条件下PCNA基因的相对表达量(REL)与生长率之间的关系,
结果发现,REL与生长率呈正相关性。 .
(4)以流式细胞术分析了同步培养的东海原甲藻的细胞周期,以RFQ.PCR
测定了PCNA基因表达量,研究了不同细胞周期中PCNA基因表达的变化。结
果表明,同其他物种的PCNA类似,东海原甲藻PCNA表达与细胞周期相关,
表达量从GI后期开始升高,在S期表达量最高。
本研究为建立PCNA相对表达量与东海原甲藻生长率之间的关系,进而运
用分子生物学技术实现东海原甲藻现场生长率的估算奠定了基础。
关键词:东海原甲藻;生长率;细胞周期;增殖细胞核抗原;细胞色素b
The ofthe betweenthe cell
study relationship proliferating
nuclear levelandthe of
antigengeneexp
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