天祝白牦牛GDF-10基因CDS区的多态性及其生物信息学分析.pdfVIP

生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2013年第11期 天祝 白牦牛 - 基因 CDS 区的多态性及 GDF 10 生物信息学分析 1，2，3 2，3 2，3 2，3 2，3 李天科   梁春年   郎侠   裴杰   吴晓云     刘建2，3  秦文1，2，3  阎萍1，2，3 （1. 甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070 ；2. 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所，兰州 730050 ； 3. 甘肃省牦牛繁育工程重点实验室，兰州 730050） 摘 要 ： 采用DNA 混合池测序法检测天祝白牦牛生长分化因子-10 （Growth differentiation factor 10 ，GDF-10 ）基因编码区 的多态性，应用生物信息学方法分析天祝白牦牛生长分化因子-10 编码蛋白质特性。结果表明，天祝白牦牛生长分化因子-10 基 因编码区序列存在8 个突变位点，其中90C → G、124C → G、1005G → A 和1232G → C 为错义突变，导致了编码氨基酸的改变， 132T → C、822A → G、873G → T 和888T → C 为同义突变；天祝白牦牛生长分化因子-10 编码蛋白质的氨基酸序列没有明显的疏 水性区域和跨膜螺旋区；其存在信号肽，说明可能在细胞质中发挥生物学作用；天祝白牦牛生长分化因子-10 编码产物二级结构 是以α-螺旋和β-折叠为主 ；氨基酸序列与普通牛的同源性为99.4% ，与人、小鼠、大鼠4 个物种间同源性较高。 关键词 ： 天祝白牦牛 - 基因 多态性 生物信息学分析 GDF 10 - Polymorphism and Bioinformatics Analysis of CDS in GDF 10 Gene in Tianzhu White Yak Li Tianke1，2 Liang Chunnian2，3 Lang Xia2，3 Pei Jie2，3 Wu Xiaoyun2，3 Liu Jian2，3 Qin Wen1，2，3 Yan Ping1，2，3 （1. College of Animal Science and Technolog ，Gansu Agricultural University ，Lanzhou 730070 ；2. Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences of Chinese Academy of Agricultural Sciences ，Lanzhou 730050 ；3. Key Laboratory of Yak Breeding