甘蔗液泡ATP酶C亚基基因克隆及其序列分析.pdfVIP

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2016-05-13 发布于安徽
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甘蔗液泡ATP酶C亚基基因克隆及其序列分析.pdf

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生物技术通报 BIO TE CHN OLOG Y B ULLETIN 20 10 9 ATP C 1, 2 1 1 1 许志宇王俊刚杨本鹏张树珍 1 2 ( , 571101; , 570228) : 根据筛选文库时获得的 EST序列信息, 利用 RA CE技术分了一个甘蔗ATP酶 C亚基基因, 命名为 ShVHAC 该基因 cDNA 全长 1 312 bp, 含有 1 056 bp的完整阅读框架, 编码 35 1 个氨基酸序列比对及结构预测分析表明, ShVHAC编码的氨基酸序列与水稻小麦苜蓿绿豆和蓖麻中相应基因氨基酸序列的一致性分别达到 9410% 9322% 9115% 9115% 和 9174% , 与水稻一致性最高在整个二级结构中, 含有 233 个螺旋( lph helix), 占 6638% ; 含有 5 个延伸链 ( extended str nd), 占 142% ; 含有 113 个无规则卷曲( r ndom coil) , 占 3219% 此蛋白不具有导肽整个多肽链表现为亲水性, 没有明显的疏水区域, 初步认为甘蔗 ShVHAC编码蛋白是亲水性蛋白 : 甘蔗糖分积累 VATP se RACE 序列分析 Cloning and Sequence Analysis of Vacuolar ATPase Subunit C Gene from Saccharum off icinarum L. Xu Zh iyu1, 2 W ng Jung ng1 Y ng Benpeng1 Zh ng Shuzhen1 1 ( K ey Laboratory of M inistry of A griculturef or Trop icalB iotechnology, Institute of Trop ical Biosciences and B io technology, Chinese 2 A cademy of Trop icalAgricultural Sciences,H ai ou 571101; College of Agriculture,H ainan University,H ai ou 570228) A bstrac:t B sed on EST sequence from n ethphoninduced l tex SSH cDNA libr ry ofSaccharum off icinarum L., fu lllength cD + NA encodingH ATP seC subunit, design ted s ShVHAC, w s cloned from Saccharum off icinarum L. by RA CEPCR, wh ich h s tot l length of 1 312 bp w ith n open re d ing fr me( ORF) of 1 056 bp nd encodes 351 m ino cid residues. The deduced m ino cid sequence showed h igh identity of 9410%, 9322