一种基于 rna-seq 的基因组注解评估方法.pdfVIP

2013 年 第 58 卷 第 33 期：3471 ~ 3482 《中国科学》杂志社 论 文 SCIENCE CHINA PRESS 一种基于RNA-Seq 的基因组注解评估方法 * 王颖, 刘麟 厦门大学信息科学与技术学院自动化系, 厦门 361000 * 联系人, E-mail: wangying@ 2013-03-26 收稿, 2013-07-10 接受 国家自然科学基金和美国国立卫生研究院基金(NIH/NIMH 5 RC2 MH090047-01)资助 摘要 新一代测序技术下RNA-Seq 测序数据为解码真核生物的转录组带来了突破性的变革, 其 关键词 细致到碱基层面的高分辨率信息, 使得仅采用RNA-Seq 作为唯一数据源便可对现有的基因组进 基因组 行注解. 同样地, 利用RNA-Seq 信息也能验证现有的剪切位点、外显子乃至转录物的注解信息. 转录组 因此本文提出利用RNA-Seq 数据对现有的基因组注解数据库进行评估, 基于RNA-Seq 的配准