生物无机化学基础知识分析报告.ppt

第二章 生物化学基本知识 第一节 生命元素 第二节 生命配体(氨基酸,蛋白质,核酸) 第三节 酶 第四节 常见的几种辅酶 第一节 生命必需元素及其动态平衡 生命是一个复杂的过程,但必需满足以下6个条件: 1.能够从它周围环境的原材料中生产它自己所需的组成成分; 2.能够从它周围的环境中吸取能量并将其转化为不同形式的功,从而使自身保持生存; 3.催化能够维持其生命活动的各种化学反应; 4.为生物合成及其他生物过程提供准确的信息以保证其准确的再生; 5.使其自身保持相对的隔离状态,从而保证与外部环境的交换在严格的条件控制下进行; 6.调控其自身活动,以便在环境变化的情况下保持其动态结构。 定义：它们的缺乏会导致生物组织严重的，不可逆的 损伤。严格讲,必需元素应该满足以下几个条件： 首先，这些元素在不同组织中均有一定浓度； 其次，除去这些元素会造成这些组织在生理或结构上的不正常； 再次，这些元素的存在能够使生物生理或结构的不正常现象消失或预防不正常现象的产生； 最后,这些元素有专门的生物功能。 目前为止,有24（or26??）种元素被列为哺乳动物的必需元素，其中14种为金属元素。 第二节 生命配体 蛋白质（protein） 蛋白质是生命体系中最重要的一类生物大分子，是生命活动的主要承载者以及生命现象的主要物质基础。据统计，大约1/3的蛋白质为金属蛋白。它们的生物功能可分为： 具有催化功能的蛋白质---酶(enzyme)。生物体内的化学反应几乎都是在生物催化剂催化下完成的。酶是生物催化剂中最重要的一类。研究金属酶的结构，功能，催化机理及其模拟构成了生物无机化学的主题。 具有运输功能的蛋白质； 具有营养贮存功能的蛋白质； 具有结构功能的蛋白质； 具有防御功能的蛋白质； 具有调控功能的蛋白质；如胰岛素(insulin)，锌指蛋白(zinc finger protein)等。 pKa proteins 嘌呤和嘧啶(Hydrogen bond) 构成蛋白质的20种氨基酸在可见光区都没有光吸收，但在远紫外区(220 nm)均有光吸收。 在近紫外区(220-300nm)只有酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有吸收光的能力。 氨基酸残基可能的配位方式 Cys-M Cys-M2 His-M(ε-nitrogen) His-M(δ-nitrogen) Asp-M Asp-M Asp-M Monodentate Bidentate, chelating Bidentate, bridging Similar structures are formed by glutamic acid Met-M Tyr-M 重要的不常见氨基酸 在少数蛋白质中分离出一些不常见的氨基酸，通常称为不常见蛋白质氨基酸,这些氨基酸都是由相应的基本氨基酸衍生而来的。 非蛋白氨基酸 除了上述构成蛋白质的氨基酸以外，自然界还存在一些并不是蛋白质组分的氨基酸，这些氨基酸通常被称为非蛋白氨基酸，至今已经发现200多种以上，它们具有不同的功能。 高半胱氨酸：甲硫氨酸生物合成的中间产物 蛋白质的结构 将蛋白质结构层次进一步细分，可在二、三级结构之间增加超二级结构和结构域两个层次。 The Structures of Proteins 蛋白质结构 一级结构 二级结构 三级结构 四级结构 超二级结构 结构域 低 高 蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目. 多肽链的氨基酸顺序， 以及多肽链内或链间二硫键的数目和位置。 其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序，它是蛋白质生物功能的基础。 牛胰核糖核酸酶的一级结构 蛋白质的二级结构 肽链的主链在空间的排列。它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。 蛋白质中的几种超二级结构 ?? motif ??? motif ? hairpin 相邻的二级结构单元经常按照一定规律、规则地组合在一起，彼此相互作用，形成在空间构象上特征的二级结构组合单位。 结构域（structural domain） 对于一些相当大的蛋白质分子，一条长的多肽链，有时要先分别折叠成几个相对独立的区域，再组装成球状或颗粒状的复杂构象（三级结构）。 这种在