奈良女子大集中講義 - kyoto university bioinformatics演示文稿.pptVIP

奈良女子大集中講義バイオインフォマティクス (10)スケールフリーネットワーク 阿久津　達也 京都大学　化学研究所 バイオインフォマティクスセンター 講義予定 9月5日 分子生物学概観 分子生物学データベース 配列アラインメント 実習１（データベース検索と配列アラインメント） 9月6日 モチーフ発見 隠れマルコフモデル カーネル法 進化系統樹推定 9月7日 タンパク質立体構造予測 相互作用推定 スケールフリーネットワーク 実習２（構造予測） 内容 背景 グラフとネットワーク スモールワールド スケールフリーネットワーク スケールフリーネットワークの構成法 Preferential Attachment (Rich-get-Richer) 階層型ネットワーク ネットワークモチーフ 関連研究 背景 システム生物学 生命をシステムとして理解 相互作用、ネットワーク推定 シミュレーション 安定性解析、制御 ネットワーク生物学 生命をネットワークとして理解 スモールワールド(1998) スケールフリーネットワーク(1999) ネットワークモチーフ(2002) ネットワークの構造上の特徴の解析 ネットワークの動的挙動の解析 グラフ 情報科学や離散数学における基礎概念 グラフは頂点集合と辺集合から構成される 頂点 ? 物　（例：化合物） 辺 ? ２個の物の間の関係　（例：化学反応） 無向グ