微生物次级代谢技术方案.ppt

4.1 引论 抗生素的生源学 抗生素生源学研究一些微生物会产生这类对其它微生物、甚至对其自身有害物质的原因及这类物质的功能。 在这方面的了解将有助于解释抗生素的形成机制和控制其生产。 抗生素的生源学(Biogenesis) 1)合成次级代谢物是作为储藏物。 2)作为正常代谢的无用的副产物。 3)大分子消化后残留的碎片。 4)解除体内有害代谢物的毒性。 5)支路代谢物。 6)竞争需要，用于抑制其它微生物，争夺有限的养分。 抗生素的生源学(Biogenesis) 7)进化遗留所致。 8)在自然界具有生态上功能。 9)调节功能，至少与形态学，分化方面有关。 10) 代谢维持产物，其作用主是代谢过程，而不是产物本身。 可根据次级代谢产物分子中的主要组分与初级代谢的关系，把次级代谢产物分成五个基本类型： 次级代谢产物的类型 糖类 许多次级代谢产物在结构上明显与糖类物质有关。它们的前体物质都是葡萄糖，但是它们的结构在次级代谢过程中被修饰了。例如，链霉素，新霉素和卡那霉素等均是分子结构被修饰了的寡糖类抗生素。 次级代谢产物的类型 多肽类 同糖类物质一样，氨基酸或其聚合物(多肽)在次级代谢过程中常常被修饰，形成多肽类抗生素。例如链霉菌产生的放线菌素是由寡肽构成的。还包括芳香族氨基酸或其他氨基酸合成途径的中间体产物被修饰后形成的抗生素。例如，委内瑞拉链霉菌产生的氯霉素和头状链霉菌产生的丝裂霉素C等。 次级代谢产物的类型 聚脂酰类 这类化合物均以活性脂酰作为前体，通过聚合作用形成的。由乙酰辅酶A可以形成两类自身缩合产物：一类是通过头尾联接的聚乙酮(酰)化合物；另一类是通过新形成的活性异戊二烯的寡聚作用形成的化合物。这类化合物可形成萜类、甾类和类胡萝卜素类次级代谢产物。属于这类次级产物的有水稻恶苗病菌产生的赤霉素等。 次级代谢产物的类型 核酸碱基类似物类 此类次级代谢产物的合成明显地与核酸碱基的合成相关。它们或者由细胞中现成的核苷酸经化学修饰转变而来，或者通过与核苷酸生物合成相似的过程合成而来。例如6-氨基嘌呤，焦土霉素，狭霉素，蛹螬菌素等。 次级代谢产物的类型 其它类型 微生物还产生一些不属于上述四种类型的次级代谢产物。因为人们很难根据这类化合物分子中的组分的来源，把它们归于上述任何一种类型的次级代谢产物。 4.2 次级代谢物生物合成的前体 4.3 次级代谢物的生物合成原理 (1) 把前体引入次级代谢物生物合成的专用途径 前体一旦合成，便流向次级代谢物生物合成的专用途径。前体聚合作用是次级代谢特有的、普遍的合成机制。 通过前体聚合作用的次级代谢物有四环类、大环内酯类、 安莎霉素类、真菌芳香化合物的聚酮类和肽类、聚醚和聚异戊二烯类抗生素。 这些特有的生物合成中间产物需作后几步的结构修饰，修饰的深度取决于产生菌的生理条件。 有些复杂抗生素是由来自不同生物合成途径的几个部分组成的。 4.4 抗生素的生物合成 天然产物类别 聚酮和非核糖体肽化合物是复杂天然产物中的两大家族，分别由简单的羧酸和氨基酸单体构成，具有重要的医药和农用化学品的特性，其生物分子的结构极其复杂多样。 虽然两者利用的底物不同，但他们的生物合成均是在一个大的多功能蛋白的控制下完成的，前者命名为PKS，后者命名为NRPS。两种复合酶均包含线性、连续重复的活性区域称之为模块，每个模块可催化多聚酮或多肽连的一轮延伸并进行适当的修饰，最后解链得到相应的产物。 一、聚酮体生物合成途径 基于商业性的原因，迄今为止，一些具有聚酮体生物合成（polyketide synthases，PKSs）途径的“天然产物”，如红霉素、阿维菌素、泰乐菌素、柔红霉素、阿克拉霉素、西罗莫司和利福霉素等； 具PKS途径的抗生素 红霉素产生菌的生物合成 参与红霉素生物合成的PKSs，或6－脱氧红霉内酯合成酶（6-deoxyerythronolide B synthase，DEBS）有6个模块组成，每个模块负责合成聚酮体中的一部分。 由于各模块之间的协调性，以及每个模块编码决定延伸单位的选择、功能和立体化学性质的催化结构域，因此，就有可能通过对PKSs结构域或模块的操作获得具有新颖结构的化合物。 PKSs基因簇的大小在10～100 kb左右不等。 PKS中的每一个模块的组成 酮基合成酶（ketosynthase，KS） 酰基转移酶（acyl transferase，AT） 酰基载体蛋白（acyl carrier protein，ACP） 这些域对于聚酮链的二碳单元的得加长是必需的。 β-酮基修饰酶：包括酮基还原酶（ketoreductase，KR）、脱氢酶（dehydrogenase，DH）和烯酰还原酶（enoylreductase，ER） 大多数典型的聚酮体合成途径的产物包括