转录组实战之表达定量和差异及功能讲义.pptxVIP

长非编码RNA测序分析实战讲解之表达定量和差异及功能分析;步骤四：表达值的定量 定量策略工具 步骤五：差异分析 差异分析工具 步骤六：功能注释 附录：运行命令 ;3;测序数据;步骤三：转录本的构建（Cufflinks/Scripture） 构建流程详解 基因存储文件: Gtf, Bed格式文件 Cuffmerge/cuffcompare合并转录本 转录本构建效果评估 多外显子比率、已知覆盖程度 步骤四：长非编码RNA的鉴定 鉴定流程详解 关键:如何判断编码或是非编码基因 工具：CNCI，CPC, PhyloCSF ;6;步骤四：表达值的定量 定量策略工具 步骤五：差异分析 差异分析工具 步骤六：功能注释 附录：运行命令 ;8;9;10;FPKM定量;长编码RNA表达定量;步骤四：表达值的定量 定量策略工具 步骤五：差异分析 差异分析工具 步骤六：功能注释 附录：运行命令 ;14;Cuffdiff输出结果;表达差异分析结果;17;18;步骤四：表达值的定量 定量策略工具 步骤五：差异分析 差异分析工具 步骤六：功能注释 附录：运行命令 ;20;David GO: 数据上传;David GO: 注释数据库选择;David GO: Functional Annotation Clustering;David GO: Functional Annotation Chart;25;步骤四：