第三章 生物信息学资源和数据挖掘工具.ppt

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* BIOINFORMATICS 数理与生物工程学院 * 3.3.1查询分子序列 在实际工作中,有可能遇到如下的问题:有些用户对分子生物学数据库极不熟悉,很难直接从各种种类繁多的数据库中查询所需信息。事实上,这类用户通常只需了解一些最基本的分子信息,例如,是否有人已做过本人研究类群(或感兴趣类群)的DNA序列?如果有,是哪些基因(序列)?等等。 * BIOINFORMATICS 数理与生物工程学院 * 有些用户不能使用英文(拉丁文)查询分子生物学数据库。例如,用户知道“睡莲”,但不知道库中是用“waterlily”还是“water lilies”,更不知道睡莲属的学名“Nymphaea”或睡莲科的学名“Nymphaeacese”。 此外,大多数用户也不熟悉不同分类系统之间的差异。例如,莲属(Nelumbo)在Engler系统中属于睡莲科,而在新的被子植物分类系统中都独立为莲科(Nelumbonaceae),即在一个信息系统中用“Nymphaeaceae”可以查询出莲属的信息,而在另一个信息系统中用“Nymphaeaceae”可能查询不出莲属信息。 * BIOINFORMATICS 数理与生物工程学院 * 这也给分类一学查询带来一定困难。 解决上述问题的方法是将用户所熟悉的特定信

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