一、简述microRNA加工成熟的主要步骤
由RNApolⅡ启动子启动转录,得一具有帽子结构和多聚胺苷酸尾巴的pri-miRNA为初产物。
Pri-miRNA在核内经RNaseⅡ enzyme Drosha,DGCR8及一个双链RNA结合蛋白组成的“微处理器”复合物处理。Drosha从pri-miRNA发夹结构末端切下八个核苷酸得到3’端有两个碱基位点,5’端为磷酸盐基团的茎环结构的产物,即pre-RNA。
3.miRNA由基因组中某个基因座位转录生成具有5’端帽子结构和多聚腺苷酸尾巴的pri-miRNA。之后在Drosha/DGCR8作用下加工成为pre-miRNA,再经Exportin-5转运至细胞质pre-miRNA经过Dicer的进一步剪切形成成熟miRNA,miRNA再与RISC以不完全互补的方式结合。
二、设计siRNA控制特定基因表达时,序列选择上有哪些注意事项?
RNAi最后要通过siRNA片段和靶基因结合并使之降解。
1 siRNA序列在靶基因中的位置
从靶基因起始密码子AUG下游50~100个核苷酸开始搜寻理想的siRNA序列,越靠近靶基因的3′端,其基因沉默效果可能越好。
2 siRNA序列的起始碱基与长度
SiRNA序列最好为AA(N n)UU(N 代表任意碱基。
3 siRNA 3′端突出碱基的选择
当siRNA 的3′端突出碱基为UU时,其基因抑制效率最
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