干细胞分化时染色质重组情况.docxVIP

干细胞分化时的染色质重组情况 Jesse R. Dixon1,2*, Inkyung Jung1*, Siddarth Selvaraj1,3*, Yin Shen1, Jessica E.Antosiewicz-Bourget4, Ah Young Lee1, Zhen Ye1,Audrey Kim1, Nisha Rajagopal1, Wei Xie5, Yarui Diao1, Jing Liang6, Huimin Zhao6, Victor V. Lobanenkov7, Joseph R. Ecker8,James A. Thomson4,9,10 Bing Ren1,11 高阶染色质结构正成为一个新兴的基因表达的重要调节器。虽然染色质的动态结构已经确定在基因组上，其在哺乳动物发展的完整的染色质动态结构范围和谱系规格还有待确定。通过在人类胚胎干细胞和四个人类干细胞导出谱系定位全基因组染色质，在谱系我们发现广泛染色质重组现象。我们观察到，尽管自缔合染色质域在分化期是稳定的，染色质在域间和域内的间显著的相互作用，改变了36%基因组内活跃或不活跃的染色体。通过单倍体解决染色质相互作用定位图和转录组数据集，我们发现多数的等位基因表达与等位基因偏倚染色质的启动子和增强子有关。我们的研究结果提供了一个全局视图的染色质动态和研究不同人类细胞谱系中远程控制的研究资源。 三维基