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11 核酸的酶促降解和核苷酸代谢 11.1 核酸的酶促降解 11.2 核苷酸的分解代谢 11.3 核苷酸的生物合成 碱基(base) 核苷 常见(脱氧)核苷酸的结构和命名 核酸分子中核苷酸之间的共价键 DNA一级结构的表示法 11.1 核酸的酶促降解 生物体内存在多种降解核酸酶类,统称为核酸酶(nuclease),在核酸降解和周转中起着重要作用。 脱氧核糖核酸酶(dexyribonuclease, DNase) 底物 核糖核酸酶 (ribonuclease, RNase) 核酸外切酶 (exonuclease) 方式 核酸内切酶 (endonuclease) 限制性内切酶:具有位点识别专一性的内切酶。 11.1.1 核酸酶 11.1.1.1 外切核酸酶 外切酶作用于核酸链一端,逐个水解下核苷酸, 是非特异性磷酸二酯酶。 11.1.1.2 内切核酸酶 内切酶特异地水解多核苷酸内部各键,是特异性强的 磷酸二酯酶。 牛胰核酸酶作用于嘧啶核苷酸磷酸二酯键,生成嘧啶 核苷-3?-磷酸或末端为嘧啶核苷-3?-磷酸的寡核苷酸。 许多RNAase都具有高度热稳定性。牛胰RNase具有高度热稳定性。牛胰RNase(RNaseⅠ)是最早分离纯化并结晶的第一个RNase,由124个氨基酸组成。 脱氧核糖核酸酶(DNase):专一水解DNA。 内切酶:切断双链或单链。 外切酶:有5?→3?切割或3?→5?切割。 牛胰脱氧核糖核酸酶(DNase Ⅰ) 切割ds/ssDNA,产物为5?-磷酸为末端的寡核苷酸。 牛脾脱氧核糖核酸酶(DNaseⅡ) 降解dsDNA,产物为以3?-磷酸为末端的寡核苷酸。 尚未发现有碱基专一性DNase,但有序列专一性,即 限制性内切酶(restriction endonuclease)。 1979年,W. Arber, H. Smith和D. Nathans等发现 某些细菌细胞内存在一类能识别一定序列并水解 外源dsDNA的内切核酸酶。 限制性内切酶是具有高度专一性DNA内切酶, 是DNA分子操作中必不可少的工具酶。 限制性内切酶能识别 dsDNA分子上特定的位点, 将两条链切断,形成粘性末端或平齐末端,称为 限制性内切酶(restriction endonuclease)或 限制酶(restriction enzyme)。 细菌除具有限制性内切酶外,还具有一种对自身DNA起修饰作用的甲基化酶。 限制性内切酶和其相应的修饰酶对底物DNA的识别和作用的部位是相同的。 修饰酶使该部位上碱基甲基化,从而使限制性内切酶对这种修饰过的DNA不再起作用。 在细胞中,限制性内切酶可降解外源侵入的DNA,但不降解经修饰酶甲基化保护的自身DNA。 限制性内切酶具很强的专一性。对底物DNA有特异的识别位点(识别序列),长度一般在4~8bp范围内。 通常具有回文结构(palindromic structure)。切割后 形成粘性末端(cohesive end)或平齐末端(blunt end)。 限制性内切酶是DNA分子剪刀,是DNA体外重组技术 和进行大分子DNA分析的重要工具。 限制性内切酶发现对基因工程研究有极大的促进作用。已发现数百种可用于DNA研究限制性内切酶、连接酶、 修饰酶等多种酶,总称为分子生物学技术的“工具酶”。 限制性内切酶命名较为特殊。(以EcoRI为例) 第1个大写E:大肠杆菌属名(Escherichia)第1个字母; 第2,3小写co:种名(coli)的头两个字母; 第4个大写R: 所用大肠杆菌的菌株; 第5个罗马字:从该细菌中分离出来这一类酶的编号。 核苷酸经核苷酸酶(nucleotidase)催化,水解为核苷及无机磷酸。 非特异性的核苷酸酶,能作用于一切核苷酸。 特异性强的核苷酸酶只能水解3?-核苷酸或5?-核苷酸,分别称为3?-核苷酸酶或5?-核苷酸酶。 核苷经核苷酶(nudeosidase) 分解为嘌呤或嘧啶和戊糖。 ①核苷磷酸化酶(nucleoside phosphorylase) 广泛存在于生命机体中,催化反应可逆; 腺嘌呤和鸟嘌呤经脱氨氧化转变为黄嘌呤再进行降解,不同种类的生物分解嘌呤的酶系不同: 灵长类,鸟类,爬行类,大多数昆虫嘌呤最终产物为尿酸; 除灵长类以外的哺乳动物,腹足类为尿囊素; 某些硬骨鱼中尿囊素再继续分解为尿囊酸; 大多数鱼类,两栖类中
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