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肽链折叠的动力学 通过对肽链折叠的动力学研究,发现折叠是分阶段进行的,可能还存在着中间态。 肽链折叠的速度和构象核 构象核:为数不多的氨基酸残基通过分子中近程相互作用先形成一个核心,即构象核。然后以其为核心,逐渐进行随后的折叠过程。 整个肽链的折叠过程存在着快慢不同的几个阶段。 构象核的形成、构象核的生长和彼此黏结、具有规正二级结构的分子框架的建立、中间态的调整,以及具有四级结构蛋白质的亚基的组装。 蛋白质肽链的折叠以结构域为单位 很多实验结果表明,各个结构域的折叠应该是相互独立的,因为迄今为止已有越来越多的单个结构域被单独表达,而且表达的产物都具有天然的活性。 一个多结构域蛋白质中的各个结构域不仅是氨基酸残基序列上的一个特定的片段,也是蛋白质立体结构中的独立的、具有生物活性的区域,而且还是一个肽链折叠过程中的独立的单位。 在细胞中多结构域的形成可能是有先后次序的。期间可能存在着一定的协调和协同。 蛋白质肽链在折叠过程中可能出现许多中间态,但是其中多数是瞬时的,而对蛋白质稳定结构的形成产生影响的中间态仅有不多几种。最常见的中间态是与肽酰基-脯氨基间肽键的顺反异构化、二硫键交换有关,可能某些还与氨基酸残基的侧链修饰有关。 扫描图片 Anfinsen经典实验表明:蛋白质折叠的必需信息都储存在一级结构中。即“序列决定构象”。 有些蛋白质移除前导序列会伴随着之后的蛋白质重折叠的缺失。相反的,全长酶原解折叠后可以重新产生一个折叠的酶。这个结果表明前导序列参与了折叠反应,这说明并不是“最终的”序列编码了折叠信息。 细胞中大多数天然蛋白质折叠都不是自动完成,而需要其他酶、蛋白质辅助. 所有细胞中发现的伴侣蛋白都是聚体体系,它阻止了不正确的蛋白质的折叠,以7个、8个或9个亚基的超环形结构为基础。超环形结构被任意端盖住,形成一个通过疏水表面结合解折叠多肽的空穴,通过ATP驱动的构象变化促使肽折叠为天然构象。 不正确的折叠导致活性失活,这是许多疾病的分子基础。 并不是所有的蛋白质都含有二硫键,特别是在细胞内的多数蛋白质是不含有二硫键的,因为细胞内的环境是个还原性的环境。 近年来的研究表明,蛋白二硫键异构酶也参与了对蛋白质功能的调节。 鸦片促黑皮质素原(POMC)的水解修饰 一、与蛋白质降解相关的末端和内部序列 细胞内的蛋白质,出于细胞活动对特异蛋白质的需要,各自都具有一定的寿命,长短不一。 此外,细胞中受损蛋白、折叠或组装错误的蛋白都应及时清除。 溶酶体是蛋白质降解的重要场所。细胞内外的蛋白质都可以通过不同的方式进入溶酶体。 细胞外的蛋白质,以及细胞质膜上的受体蛋白质,几乎都是通过胞吞方式进入溶酶体的。 细胞内蛋白质进入溶酶体有非选择性和选择性两种形式。前者又可分为自体吞噬和分泌自噬;后者则是由氨基酸残基序列模体KFERQ介导的,但在营养充足的细胞中,该途径是关闭的。 酶E1,E2和E3 E1:泛素活化酶,负责激活泛素,泛素分子被激活后被送到E2。 E2:泛素结合酶,负责把泛素分子结合在被降解的蛋白质上。 E3:泛素-蛋白连接酶,具有辨认被降解蛋白质的功能,帮助E2把泛素结合在被降解蛋白质上。 蛋白酶体(proteasome) 存在于细胞核和胞浆内,负责对泛素化蛋白质进行降解。 8.请以Anfinsen经典实验为例说明蛋白质的一级结构与其功能的关系? 9.请以血红蛋白与氧的结合为例,说明蛋白质的高级结构与其功能之间的关系? 10.*蛋白质的靶向输送(protein targeting) 信号肽(signal peptide)熔球态 构象核 11*. 根据所学,从结构、功能、折叠等方面阐述你对结构域的认识。 12.*简述蛋白质的翻译后加工主要包括哪些方面?并对每一方面进行简述。 13.与分泌蛋白的合成、转运有关的组分有哪些?简述分泌蛋白的靶向输送过程。 14*. 与核蛋白入核有关的成分有哪些,并简述核蛋白入核过程?(入核过程可图示) 15. 泛素介导的蛋白质降解途径包括的主要成分及其作用,简述蛋白质通过该途径降解的过程。 (四)细胞核蛋白的靶向输送 多种细胞核蛋白在胞液合成后输入核内, 各种大分子及核内组装的核蛋白体亚基都是通过核孔 进出核膜。 核定位序列*(nuclear localization sequence, NLS ) 所有靶向输送的胞核蛋白多肽链内含有特异信号序列 结构:为4-8AA残基的短序列, 富含带正电的赖、精氨酸及脯氨酸 肽链中位置:不只在N末端,可位于肽链不同部位。 特点:NLS在蛋白质进核定位后不被切除。 不同NLS间未发现共有序列。 真核细胞-- 有丝分裂完成后细胞核膜重建时,在胞液的各种具有NLS的胞核蛋白
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