蛋白质芯片说课.pptVIP

* 9*5阵列， 间隔600um ,喷墨技术 对50个乳癌核心组织切片样品进行 pG/mL检测限 人类约30，000个基因，编码30，000个蛋白。细胞内的蛋白分子量范围：10-125kDa Zhu 等[18]用含有5 800 个不同的酵母重组蛋白质的蛋白质芯片进行实验, * 通过直接的相互作用，由人乳状瘤病毒产生的E7蛋白诱导眼癌抑制因子RB下降，表明阻碍二者相互作用的分子可能成为一种抗癌 * 378 antibodies chip 密度脂蛋白胆固醇特别是氧化的低密度脂蛋白胆固醇及自由基都能刺激某种钙 离子通道的开放,促进钙离子进入血管平滑肌细胞和内皮细胞,而较高的细胞内钙离子浓度反 过来又能增加脂质过氧化物等自由基的产生 * 但是,蛋白芯片技术还只是在研发阶段,并没有转化为商品进行大量的使用,是因为该技术仍存在许多问题. 成本过高,目前的生物芯片技术需一系列昂贵的尖端仪器,如光刻机器、和激光共聚焦显微器等设备, 如Affymetrix的一套系统需要13. 5万美元,对普通的实验室来说开支较大,是生物芯片技术推广的一大障碍. 其次是芯片的标准化问题,即如何将不同实验室、不同操作人员做出的结果进行统一化、标准化, 如何提高芯片的特异性、简化样品制备和标记操作程序、增加信号检测的灵敏度和消除芯片背景对于结果分析的影响等等,这些都是亟待解决的问题 * 蛋白质芯片还面临着诸多挑战，未来的发展重点集中在以下几个方面 人类基因组大规模测序工作已经完成，随着以功能基因组学和蛋白质组学为主要研究内容的后基因组时代来临，蛋白质芯片作为检测蛋白质存在和运动变化的高效工具，必将发挥越来越大的作用 ；第一代蛋白检测芯片将主要依赖于抗体和其他大分子，显然，用这些材料制备复杂的芯片，尤其是规模生产会存在很多实际问题，理想的解决办法是采用化学合成的方法大规模制备抗体。 提高芯片制作的点阵速度；提供合适的温度和湿度以保持芯片表面蛋白质的稳定性及生物活性。 * 优化芯片参数包括print buffer, humidity control during arraying, and probe concentration.固定聚合物材质 蛋白质芯片技术 Protein chip 沈圆圆 张煊宜 内容提要 蛋白质芯片概述 蛋白质芯片的关键技术 蛋白质芯片的应用 展望 蛋白质芯片概述 生物芯片(B iochip)是指通过微电子、微加工技术在芯片表面构建的微型生物化学分析系统,以实现对细胞、DNA、蛋白质、组织、糖类及其他生物组分进行快速、敏感、高效的处理和分析。 这是一项融微电子、微机械、化学、物理、计算机技术等于一体,是生物学技术与其它学科相互交叉和渗透的 产物。 蛋白质芯片概述 生 物 芯 片 基因芯片 蛋白质芯片 微流控芯片 蛋白质芯片, 又称蛋白质阵列或蛋白质微阵列，是指以蛋白质分子作为配基,将其有序地固定在固相载体的表面形成微阵列；用标记了荧光的蛋白质或其他它分子与之作用，洗去未结合的成分，经荧光扫描等检测方式测定芯片上各点的荧光强度，来分析蛋白之间或蛋白与其它分子之间的相互作用关系。 / 蛋白质芯片概述 DNA芯片 与蛋白芯片最大的区别是靶分子和探针分子的结构差异。 相对于DNA 芯片, 蛋白质芯片技术相对更困难。 1、蛋白质之间的相互作用呈现出更强的变化性。 2、需要其它蛋白质的作用和翻译后修饰。 3、尚未有大量扩增蛋白质的成熟技术。 4、蛋白质的表达和纯化工作十分艰巨, 易失活，不稳定。 蛋白质芯片概述 优点： (1)蛋白芯片是一种高通量的研究方法，能在一次实验中提供大量的信息，使我们能够全而、准确地研究蛋白表达谱； (2)灵敏度高，它可以检测出蛋白样品中微量蛋白的存在，检测水平已达ng级； (3)所需的样品量极少。 研究蛋白质芯片的意义 蛋白质是基因表达的最终产物, 接近生命活动的物质层面； 探针蛋白特异性高、亲和力强, 可简化样品前处理，甚至可直接利用生物材料(血样、尿样、细胞及组织等)进行检测； 适合高通量筛选与靶蛋白作用的化合物； 有助于了解药物或毒物与其效应相关蛋白质的相互作用。 根据制作方法和用途 蛋白质检测芯片 蛋白质功能芯片 蛋白质芯片的关键技术 蛋白质芯片比较 表面 蛋白固定方式 优点 缺点 PVDF 吸附 无需蛋白修饰过程，高结合容量 非特异吸附，分布随机 Nitr