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真核细胞DNA的提取 二、实验原理: 核酸分子是基因工程研究的主要对象。核酸样品的质量直接关系到基因研究一系列试验的成败。 核酸包括脱氧核糖核酸DNA 和核糖核酸RNA 两种分子。 在生物体中核酸常与蛋白质结合在一起,以核蛋白的形式存在。由于,脱氧核糖核蛋白与核糖核蛋白在电解质溶液中溶解度明显不同,据此可将二者分离。 植物细胞经过充分冷冻,细胞核在研磨时容易破裂,利于提取DNA.DNA在低温下易于凝集。 植物总 DNA 的抽提常采用两种方法: SDS 法和 CTAB 法。 CTAB 法:简便、快速, DNA 产量高,但纯度稍次,适用于一般分子生物学操作。 CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)是一种非离子去污剂,植物材料在 CTAB 的处理下,结合 65℃ 水浴使细胞裂解、蛋白质变性、 DNA 被释放出来。 CTAB 与核酸形成复合物,此复合物在高盐( 0.7mM )浓度下可溶,并稳定存在,但在低盐浓度( 0.1 ~ 0.5mM NaCl )下, CTAB- 核酸复合物就因溶解度降低而沉淀,而大部分的蛋白质及多糖等仍溶解于溶液中。经离心弃上清后, CTAB- 核酸复合物再用 70 % ~ 75% 酒精浸泡可洗脱掉 CTAB 。再经过氯仿 / 异戊醇( 24:1 )抽提去除蛋白质、多糖、色素等来纯化 DNA ,最后经异丙醇或乙醇等 DNA 沉淀剂将 DNA 沉淀分离出来。 SDS 法:过程长,纯度高。阴离子去污剂十二烷基硫酸钠(SDS)能破坏细胞膜,并能解聚脱氧核糖核蛋白复合物(DNP),使DNA从脱氧核糖核蛋白中释放出来。 SDS使脱氧核糖核蛋白中的组蛋白分离变性形成沉淀,从而得到纯净的DNA。利用DNA不溶于乙醇等有机溶剂的特点将DNA沉淀下来。 1.仪器 各量程微量移液器;研钵;水浴锅;离心机; 液氮贮存装置;制冰机;天平 2.试剂及相关耗材 各式微量移液器枪头;Dorf管;SDS 提取缓冲液 ( 100mM Tris-HCl , pH8.0 ; 50mM EDTA , pH8.0 ; 0.5M NaCl ; 10mM β- 疏基乙醇,使用前加入); 20 % SDS ; 5M KAc ; CTAB 提取缓冲液( 2% CTAB , 1.4M NaCl , 20mM EDTA , 100mM Tris-HCl , pH8.0 ) ; 氯仿 / 异戊醇( 24:1, v/v ) ; 4M NaCl ;无水乙醇; 75% 乙醇; TE 缓冲液。 一) CTAB 法提取桉树叶片 DNA 1 .植物组织的破碎:取 0.2-0.4g 新鲜的桉树叶片,在液氮中研磨至粉末状,转入 1.5ml 离心管中。 2 .细胞的破碎:迅速加入 1ml 预热( 65 ° C )的提取缓冲液, 65 ° C 水浴中保温 30min 以上,每 5 min 上下颠倒 1 次。 3 .核酸的分离: 12000g 离心 5 min ,吸取上清液约 600μl ,加入等体积氯仿 / 异戊醇( 24:1 ),上下颠倒数次,至下层液相呈深绿色为止。 4 . 12000g 离心 5 min ,取 450μl 上清于一新 1.5ml 离心管,加入 1ml 95% 乙醇和 45μl 10M NH 4 Ac ,混匀,室温放置 10min 。 5 . 12000g 离心 10min ,去上清,用 75% 乙醇浸洗沉淀,自然干燥约 30 min 。 6 .核酸的溶解:加入 50μl TE 或无菌水(含 20μg/ml RNase ),置于 4℃ 过夜,待 DNA 溶解后,检测 DNA 浓度及质量。 7.核酸的纯化:加入等体积的异丙醇室温下沉淀 DNA ;用 70% 的乙醇清洗沉淀;沉淀经室温干燥后溶于 500 m l TE缓冲液中。 5 . 4℃ 下 12000g离心 15 min ,取上清至新管,加入等体积的氯仿 / 异戊醇( 24:1 )抽提,轻轻颠倒数次,放置片刻。 6 . 4℃ 下 10000g 离心 10 min ,吸取上层水相到另一离心管中,加入 2/3 体积 -20℃ 预冷的异丙醇,混匀,室温静置 30min ,观察沉淀生成。 7 . 4℃ 下 8000g 离心 10 min ,倾去上清液,用 75% 的乙醇洗涤沉淀,吹干。 8 .用 100μl TE 充分溶解, -20℃ 存放备用。 DNA提取常见问题 1 .核酸 DNA 分子对机械力十分敏感。因此操作过程中动作应尽量轻柔, 转移用的枪头最好是剪过的, 避免剧烈振动可获得较长的 DNA 分子。 2 .尽量取材幼嫩叶片,如太老,酚类物质多,必须用 10mM 的 β-ME 处理。 3 .所用试剂必需灭菌,带手套操作。 4
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