寻找启动子区域和预测转录因子结合位点介绍.pptVIP

目的： 寻找promoter区域 预测Transcription factor binding site 寻找promoter区域 用NCBI：/ 用UCSC：/ 用Ensembl：/index.html 用公司信息（只包含公司拥有promoter clones的信息）： / 寻找promoter区域 NCBI ttp:///pubmed/ 选择Gene, 输入ankh,点击search 选择第一项，人类Homo sapiens的ANKH Chromosome 5 location14871887, complement(反义链)即到 基因范围 此例中选取到约2000bp核苷酸序列作为启动子区域 寻找promoter区域 点击GraphicsToolsSequece Text View 寻找promoter区域 点击Go To Position, 输入点击Prev Page找到具体位置 复制白底黑色区域即为promoter区域。 寻找promoter区域 在前两张幻灯片中选择FASTA 在右边Change region shown输14873887 Display options选择Show reverse complement