二生物信息学数据库及检索预案.ppt

常用数据库简介 文献检索 PubMed PubMed BioMail / 查询GenBank数据库的目的 2. 己通过实验手段获得了某个或某些新的序列，希望先对其进行简单的序列注释；或者利用已知序列去搜索其它基因组中的同源基因等等。 1. 自己对某个基因感兴趣，但目前所研究材料中尚没有相关的信息，需要以其它亲缘关系较近的物种中已测序或已提交了的该基因的序列为参考，设计引物，在目标基因组中钓取该基因； 例子： 已知水稻中已克隆了与细胞程序性死亡相关的重要基因LSD1，但目前小麦中尚无该基因的相关信息，就可通过查询GenBank数据库的方式，先找出水稻LSD1基因的序列，然后利用Primer5等软件设计引物，通过RT-PCR等方法完全有可能在小麦中分离得到相应的基因。 /entrez/query.fcgi?db=PubMed PubMed is a service of the U.S. National Library of Medicine that includes over 17 million citations from MEDLINE and other life science journals for biomedical articles back to the 1950s. PubMed includes links to full text art