基于R的群落学多元统计分析重点.pptVIP

致谢 本课件基于米湘成博士R培训ppt基础上修改，在此表示致谢！ 持之以恒=R的高手！ * * 第一主成分代表海拔高度，第二主成分代表坡向 * 如果一个物种靠近某个样方，表明该物种可能对该样方的位置起很大的作用。特别是对于二元数据的排序，这个样方可能就代表该物种。 如图中，20号样方与短柄枹(QUESER)靠得比较近，表明：短柄枹表征了20号样方的特征，19号样方与20号样方距离近，生态关系也较近。 只在少数样方出现的物种通常在排序空间的边缘，表明它们只偶然发生，或它们只在稀有生境（如米槠CASCAR）。 在排序空间中心的物种，可能在取样区域是该物种最优分布区，如甜槠，或有两个或多个最优分布区，或与前两个轴不相关。 除趋势对应分析(Detrended correspondence analysis, DCA)： CA采用单峰曲线表示物种和环境关系 CA产生的弓形效应 CA的第二排序轴在许多情况下是第一轴的二次变形，即所谓的“弓形效应”（Arch effect）或者“马蹄形效应”（horse-shoe effect）。 （详见张金屯《群落生态学》168页） × 和?分别代表除趋势前和除趋势后的样方排序 （引自Hill 和Gauch 1980） DCA在R中的实现采用函数decorana。 decorana(veg, iweigh=0, iresc=4, ira