13第八章微生物分类与鉴定.ppt

第一节 微生物的分类单位与命名 微生物分类的目的：把各种微生物按照它们的亲缘关系分群归类，排成系统，以便于人们对微生物进行鉴定和交流。 微生物的主要分类单位：界、门、纲、目、科、属、种、变种、亚种（小种）、型、菌株（品系） 种是最基本的分类单位 常用的几种分类概念 群：有些微生物的特征介于两种微生物之间，我们把这两种微生物及其中间类型统称为一个群。 种：亲缘关系较近的微生物有机体的集合，它们在进化发育阶段上有一定的共同形态和生理特征。现代分类学上规定种内菌株的DNA同源性≧70%。 亚种：进一步细分种时所用的单元，一般指除某一明显而稳定的特征外，其余鉴定特征都与模式种相同的种。 变种：亚种的同义词，故在《国际细菌命名法规》中已不主张再用这一名词。 亚种以下的分类单元很多，不受“国际命名法规”的限制 二、微生物的命名 （二）微生物分类的依据 形态特征：个体形态（形状、大小、染色反应等）、群体形态（菌落特征、液体培养特点等） 生理生化特征：代谢产物、营养要求、细胞壁成分等的测定 生态特征：微生物间各种相互关系的利用 遗传特征：DNA同源性分析 G+C的含量 其它：全细胞蛋白的分析、多位点酶的分析等 （三）微生物的常用分类系统 细菌：伯杰氏鉴定细菌学手册（第八、第九版）、细菌系统学手册（第一版） 放线菌：中国科学院微生物研究所编著的放线菌目分科、分属检索表 真菌：Smith、 Alexopoulos 、 Ainsworth的分类系统 第二节 微生物鉴定 * 第九章 微生物的分类与鉴定 分类（classification）：是根据一定的原则（特征的相似性或系统发育相关性）对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便考察和对未被分类的微生物进行鉴定。 鉴定（identification）：是借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定新发现的或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。 微生物分类学（microbial taxonomy）：研究微生物分类理论和技术方法的科学。研究内容包括分类、命名和鉴定。 命名（nomenclature）：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称。 一、微生物的分类单位 型：自然界存在的差异较小的同种微生物的不同类型，称为型。如结核分支杆菌依其寄主的不同可分为人型、牛型和禽型。 菌株（品系）：来源不同的同种微生物的纯培养，均可称为菌株。 菌株的名称可随意定，如大肠埃希氏菌的两个菌株： Escherichia coli K12 基因组1997年发表 Escherichia coli O-157:H7 基因组2000年发表 枯草芽孢杆菌： Bacillus subtilis AS 1.398 蛋白酶生产菌 两歧双歧杆菌： Bifidobacterium bifidum ATCC 29521 两类：地区性俗名(common name) 学名（scientific name）：学术界公认，便于交流 如结核杆菌 俗名：Tubercle bacillus 学名：Mycobacterium tuberculosis (结合分支杆菌) 微生物的学名： 双名法（binomial nomenclature）：瑞典植物学家林奈1753年首创，现用于所有生物的命名。 1、双名法的组成：拉丁文 属名＋种名（＋命名人及发表年） 名词 形容词 属名第一个字母大写。 Saccharomyces cerevisiae Hansen 汉逊啤酒酵母 斜体 斜体 正体 属名 种名 命名人 Escherichia coli K12 基因组1997年发表 Escherichia coli O-157:H7 基因组2000年发表 枯草芽孢杆菌： Bacillus subtilis AS 1.398 蛋白酶生产菌 两歧双歧杆菌： Bifidobacterium bifidum ATCC 29521 2、属名的确定 微生物的主要形态、生理特征、研究者的人名等。 3、种名的确定 微生物的形状、颜色、用途、地名、人名等 4、不用种名时的表示法 属名＋sp.（单数） 属名＋spp.（复数） Streptoccoccus sp. 一种链球菌 Flavobacterium spp. 若干种黄杆菌 属名可缩写，如E. coli 5、三名法（trinomial nomenclarure） 微生物是亚种（subspecies，简称“subsp”）或变种（variety，