分子进化与分子系统学.pptVIP

《进化生物学》 第9章 分子进化与分子系统学 一、什么是分子进化？ 分子进化即生物进化过程中蛋白质和核酸分子结构的变化以及这些变化与生物进化的关系。 1. 什么是分子进化速率？ 指蛋白质和核酸等生物大分子在进化过程中核苷酸或氨基酸残基发生替换的频度。 二、分子进化的特点 （一）分子进化速率的恒定性 （二）分子进化的保守性不同 （一）分子进化速率的恒定性 研究方法主要是通过比较不同种生物同源蛋白氨基酸序列的变化，来推测该蛋白质的进化速率。 2. 进化速率的计算 1)、氨基酸差异比例的计算 Pd=daa/Naa daa为用于比较的同源蛋白质之间氨基酸差异的数目 Naa比较的蛋白质之间氨基酸的总数 人与鲨鱼之间血红蛋白α链相差74个, 血红蛋白α链氨基酸总数为139: Pd=daa/Naa=74/139=53.2% 2)、氨基酸差异比例的校正 用比较的两个蛋白质间每个氨基酸座位替换的平均数Kaa来表示 Kaa=-2.3Log10(1-Pd) 人与鲨鱼之间血红蛋白α链氨基酸差异比例校正为: Kaa=-2.3Log10(1-53.2%)=75.8%(近似于0.76) 蛋白质现存的差异，