第四章 蛋白质讲课.ppt

第 一 章 蛋白质的化学 Chemistry of Protein 什么是蛋白质(protein)? 由许多氨基酸通过肽键相连形成的高分子含氮化合物 生物学重要性 组成成分 参与多种生理功能 氧化供能 第 一 节 蛋 白 质 的 分 子 组 成 The Molecular Component of Protein 一、元素组成 主要元素: C、H 、O 、 、S 微量元素: 铁、铜、锌、锰、钴、钼、 磷、碘 二、氨基酸 (amino acids) （一）氨基酸结构 组成人体蛋白质的氨基酸仅20种 α-氨基酸(Pro除外) L-氨基酸(Gly除外) （二）氨基酸的分类 （二）氨基酸的分类 特殊分类 含硫：Cys、Met 含酰胺：Asn、Gln 含羟基：Ser、Thr、Tyr 芳香族：Phe、Tyr、Trp 支链：Val、Leu、Ile 含胍基——Arg；含咪唑基——His 含吲哚基——Trp （二）氨基酸的分类 按营养需要 特殊氨基酸 第 二 节 蛋 白 质 的 分 子 结 构 The Molecular Structure of Protein 若让你研究一个未知蛋白质的结构，你最先想弄清什么？随后你该如何由简单到复杂地研究？ 一、一级结构 1.定义 蛋白质分子中氨基酸的连接方式、排列顺序和二硫键所在的位置 2.维系键 肽键,有些包括二硫键 3.肽键(peptide bond) 　　　由一个氨基酸的?-羧基与另一个氨基酸的?-氨基脱水缩合而形成的化学键 5.一级结构的测定 氨基酸组成的分析 N末端分析方法 DNFB法 酶解法（内肽酶） 例题 今有一个七肽，经分析氨基酸组成为Lys 、Pro、Arg、Phe、Ala、Tyr和Ser。此肽未经糜蛋白酶处理时，与FDNB反应不产生?-DNP-氨基酸。经糜蛋白酶作用后为两个肽段，分别为Ala、Tyr、Ser和Pro、Phe、Lys、Arg。此肽段分别与FDNB反应，可分别产生DNP-Ser和DNP-Lys。若与胰蛋白酶反应也生成两段肽，分别为Arg、Pro和Phe、Tyr、Lys、Ser、Ala。试问此七肽的一级结构怎样？ 二、空间构象 （二）维系键：次级键 氢键 范德华力 疏水键 离子键 二硫键 二、空间构象 空间构象按的范围及复杂度分为 二级结构 三级结构 四级结构 （三）二级结构 1.定义 指蛋白质分子中某段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及氨基酸残基侧链的构象 2.维系键 氢键 肽链以肽平面为单位可形成几种构型? α- 螺旋 β- 折叠 β- 转角 无规则卷曲 ?-螺旋结构特点 右手螺旋 每3.6个氨基酸残基上升一圈，相当于0.54nm 每一个氨基酸残基中的NH和前面相隔三个残基的C＝O之间形成氢键 侧链R分布在螺旋外侧，其形状、大小及电荷影响α－螺旋的形成 ?-折叠 ?-折叠结构特点 肽链相当伸展，肽平面之间折叠成锯齿状，相邻肽平面间呈110°角。氨基酸残基的R侧链伸出在锯齿的上方或下方。 两条肽链或一条肽链内的两段肽链间的C＝O与H形成氢键 两段肽链可以是平行的，也可以是反平行的.正、反平行能相互交替,平行的结构中，两个残基的间距为0.65nm；反平行的结构，则间距为0.7nm。 β-转角 四个AA残基的1位-CO-与4位-NH-形成氢键,造成180°回折,其封闭环含10个原子 (四)超二级结构（基序） 1. 定义 在许多蛋白质分子中，可发现两个或两个以上具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个有规则的二级结构组合 2. 组合形式 ??；???；?? (四)超二级结构 3.模体(motif) 是具有特殊功能的超二级结构，它是由两个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象。 （五）三级结构 1.定义 整条肽链中全部氨基酸残基的相对空 间位置。即肽链中所有原子在三维空 间的排布位置. 2.维系键 次级键 肌红蛋白(Mb) 3.结构域(domain) 在分子量较大的蛋白质分子中，多肽链上相邻的超二级结构紧密联系，进一步折叠成一个或多个相对独立的致密区域，并各行使功能。 （六）四级结构 1.亚基(subunit) 有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链每一条多肽链都有完整的三级结构，称为亚基 。 2.四级结构 蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用，称为四级结构。 3.维系键 氢键和离子键 血红蛋白(Hb) 第 三 节