细菌多样性的开题教程.ppt

多 相 分 类 学 鉴 定 表型 遗传型 系统发育 表达 特征 化学 分类 形态、大小、染色、运动性、鞭毛和荚膜 生理生化(API 50CH) 酶学(API ZYM) 脂肪酸 醌 全基 因组 部分 基因组 DNA相似性（杂交） G+C （摩尔百分含量） 16S rDNA序列同源比对 16S rDNA序列进化分析确定进化地位 2.3 可行性分析 1）本研究采用的实验方法和技术路线都是非常成熟的。 2）我们实验室可以提供完成本研究的相关条件。 3）本人在微生物学和分子生物学理论方面知识扎实，查阅了大量的文献，在导师、师兄和师姐的指导下，积累了丰富的实验经验。这为我实验的顺利进行奠定了理论和实践基础。 2.4 特色与创新 特色 本研究选取的样点是世界保存较完整、较偏僻、未受人类活动污染的自然胡杨林保护区。 首次对具有耐盐碱、耐热、耐旱、耐寒、耐贫瘠特性的胡杨树中抽出茎杆液进行内生细菌的多样性分析。 创新 1）首次对胡杨茎杆内生细菌进行研究，初步阐明胡杨内生细菌的多样性和种群结构。 2）对分析胡杨内生菌的多样性提供新的数据。 3）对特色菌株进行精确的分类学鉴定。 3. 预期结果 1)初步鉴定塔河中游胡杨内生细菌的生态分布及优势种。 2)期待发现1-2株新种或新纪录种。 3)向GenBank注册细菌16SrDNA序列≥30个。 4)拟发表文章1-2篇。 2009年4月-2009年5月 采样 2009年5月-2009年6月 查阅文献 2009年6月-2010年1月 分离纯化与保种 2010年1月-2010年5月 分子鉴定 2010年5月-2010年6月 多样性分析 2010年6月-2010年9月 拮抗菌株的筛选 2010年9月-2011年2月 特色产物分析 2011年2月-2011年5月 实验结果分析及数据处理，撰写 论文 2011年5月-2011年6月 送审论文，毕业答辩 4. 实验计划 5.参考文献 [1] 杨海莲,孙晓璐.宋末.植物内生细菌研究.微生物通报, 1998,25(4):224- 226. [2] 赵东红,陆玲,秦怀兰.一种微生物发酵产蓝色素的稳定性及毒研究.食品与发酵工业,1998,24(5). [3] 东秀珠, 蔡妙英. 常见细菌系统鉴定手册. 北京: 科学出版社, 2001. [4] 谷苏, 邵华, 蒋晓华, 等. 药用植物内生真菌多样性及其活性成分的潜在应用价值. 中国药学杂志, 2001,36(1): 14?15 . [5] 杨瑞先,陈立军,等.油菜内生细菌种群多样性分析.西北农林科技大学学报(自然科学版),2005:33 . [6]乔海莉; 田呈明; 骆有庆; 冯晓峰; 孙建华; 赵新丽 .新疆天然胡杨林土壤微生物多样性的研究 .北京林业大学学报.2007: 5. [7] Shimizu M, Nakagawa Y, Sato Y, et al. Studies on endophytic actinomycetes (I): Streptomyces sp. isolated from Rhododendron and its antifungal activity? J Gen Plant Pathol, 2002, 66(4): 360?366. [8]Bowen, G.D., Rovira, A.D., 1991. In: Waisel, Y., Eschel, A., Kafkafi, U. (Eds.), Plant Roots: The Hidden Half. Marcel Dekker, New York, pp. 349–388. [9] Chaintreuil, C., Giraud, E., Prin, Y., Lorquin, J., Ba?, A., Gillis, M., de Lajudie, P., Dreyfus,B., 2000. Photosynthetic Bradyrhizobia are natural entophytes of the African wild rice Oryza breviligulata. Appl. Envi