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第六章 RNA 的结构 ——RNA结构的复杂性和多样性 决定RNA结构的复杂性和多样性的因素: 与DNA不同, RNA组成是复杂和多样的,RNA组成是的复杂性决定了其结构的复杂性和多样性。有如下决定因素: 1. RNA中的碱基配对方式多种多样 碱基配对可以由几乎是全排列的各种碱基配对方式。 一、RNA的一级结构与序列分析 (一) RNA的一级结构 RNA也是由3→5’的磷酸二酯键连接成的无分支链大分子。 RNA分子的形状: 细胞 RNA:通常都是线形*单链分子。 病毒 RNA:有双链、*单链、环状、线型多种形式。 RNA的基本组成单位: NMP:AMP、GMP、CMP、UMP。 这些核苷酸中的戊糖不是脱氧核糖是——核糖。 RNA种类多,种类不同结构也各不相同。 1. tRNA的一级结构 酵母丙氨酸 tRNA: 是第一个被测定核苷酸序列的RNA,由76个核苷酸组成。 tRNA:通常由73~93个核苷酸组成。含有较多的稀有碱基,因而增加了识别和疏水作用。 保守序列: tRNA 的5′端多为G(也有C), 3′端皆为CpCpA-OH尾。 tRNA一级结构的保守序列与其特殊的结构和功能有关。 2. rRNA的一级结构 各种rRNA: 5S: 120个核苷酸、无修饰成分、与tRNA、大亚基的 rRNA 和蛋白质相互识别和作用。 16S: 10个甲基化核苷 5.8S:160个核苷酸、有假尿嘧啶修饰核糖、有与细菌 5S 相似的序列和某些相似的功能。 18S: 43个甲基化核苷 23S: 20个甲基化核苷,(还有假尿嘧啶核苷) 28S: 74个甲基化核苷,(还有假尿嘧啶核苷) rRNA的功能: (1)核糖体的骨架 (2)与mRNA和tRNA作用,催化肽键的形成。 (3)促进蛋白质合成的正常进行。 3.真核生物的mRNA的一级结构. mRNA的一级结构mRNA(信使RNA): 是蛋白质合成的直接模板。 mRNA的核苷酸序列决定相应蛋白质的氨基酸序列。 真核生物的mRNA的一级结构 如图所示,5’端有帽子结构(cap),依次为5’非编码区、编码区 、 3’非编码区, 3’端为聚腺苷酸(polyA)尾巴。 真核生物的mRNA的5’端有帽子结构(cap) —— 7-甲基鸟苷(图) 帽子结构通常有三种类型 除真核生物mRNA外,5’端帽子结构也是高等动植物病毒mRNA所特有的,有的病毒RNA具有特殊的帽子结构。这些帽子结构都是转录后早期加上去的。 帽子结构对于mRNA的翻译活性是重要的,它可使mRNA免遭外切核酸酶的降解和mRNA与核糖体的结合包括翻译起始区的辨认都是重要的,帽子结构与蛋白质合成的启动有关。 mRNA中的非编码区 无论原核或是真核生物mRNA都存在5‘端和3’端的两 个非编码区。由间隔转录得到的非编码区广泛存在于原核 生物mRNA中。在噬菌体R17 RNA 的外壳蛋白和复制酶 基因之间还存在相邻的终止密码子UAA和UAG 。这种现 象可能是噬菌体RNA为了防止密码子读过头而设置的一种 重复终止信号,可以保证蛋白质合成的准确终止。 二、RNA的二级结构 1.RNA的二级结构元件 DNA仅有一种二级结构——双螺旋。 RNA有多种二级结构元件: 单链(无规线团)、双链(茎区)、错配、 发夹(茎环)、内环、突环、两茎连接、 四茎连接等。 二级结构元件的不同组合,可以组成各种不同的RNA 二级结构。 同样,在此基础上形成更加复杂的三级结构。 下面是RNA多种二级结构元件图: 2.RNA中的碱基配对方式多种多样 DNA中的碱基对: DNA中只有A-T与G-C两种碱基对,并且是标准的Watson-Crick碱基对。这种碱基对具有二次旋转对称性,即一个碱基对翻转180°,并不影响双螺旋的对称性,因此双螺旋结构只限定了配对的方式,并不限定碱基的顺序。
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