有机质来源对洱海底泥垂向微生物群落组成影响.pdf

有机质来源对洱海底泥垂向微生物群落组成的影响 目录 摘要……………………………………………………………………………………………………………。i Abstract………………………………………………………………………………………………………………ii 缩略语表………………………………………………………………………………一iv 第一章文献综述………………………………………………………………………1 l 湖泊中的有机质……………………………………………………………………一1 1．1湖泊中有机质的分类与来源…………………………………………………一l 1．2有机质的生物利用……………………………………………………………一2 1．2．1藻源性有机质的利用……………………………………………………2 1．2．2水生植物来源的有机质的利用…………………………………………6 2．底泥中的微生物………………………………………………………………………9 2．1底泥中微生物数量……………………………………………………………一9 2．2微生物对有机质的分解………………………………………………………lO 2．3底泥中微生物群落研究………………………………………………………10 2．3．1沉积物中微生物研究方法……………………………………………一12 2．3．2沉积物中微生物群落研究现状………………………………………一13 5 3有机质对底泥微生物群落的影响…………………………………………………l 4本研究的目的与意义………………………………………………………………17 第二章DNA提取方法对底泥垂向微生物群落分析的影响…………………………一18 8 l引言……………………………………………………………………………………………………一l 2材料与方法…………………………………………………………………………·20 2．1采样……………………………………………………………………………20 2．2理化分析………………………………………………………………………21 2．3 DNA提取与纯化……………………………………………………………2l 2．3．1经典法眦1)……………………………………………………………21 2．3．2试剂盒法(M2)………………………………………………………21 2．4 DNA检测…………………………………………………………………………2l 2．5 PCR扩增……………………………………………………………………‘22 2．5．1引物选择………………………………………………………………一22 万方数据 华中农业大学2014届博士研究生学位(毕业)论文 2．5．2 PCR体系…………………………………………………………………………………··22 2．5．3 PCR扩增程序…………………………………………………………22 2．6 DGGE变形梯度凝胶电泳…………………………………………………·23 2．6．1变性胶的制备…………………………………………………………·23 2．6．2加样……………………………………………………………………………………………23 2．6．3电泳及染色……………………………………………………………·23 2．6．4电泳结果检测…………………………………………………………·23 2．6．5凝胶电泳图谱多样性分析……………………………………………”23 2．6．6细菌群落组成聚类分析………………………………………………一2