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第一章遗传物质的分子结构性质和功能研讨
药学分子生物学
Pharmaceutical molecular biology
;绪论第一章 遗传物质的分子结构、性质和功能;什么是分子生物学?;分子生物学(molecular biology)是在分子水平研究生命现象的科学,是现代生命科学的“共同语言”,它的核心内容是通过对生物的物质基础—核酸、蛋白质、多糖等生物大分子结构、功能及其相互作用的研究来阐明生命的分子基础。
狭义的分子生物学侧重于核酸的分子生物学,基因的复制、转录、表达和调控等。;;;;请回答以下几个问题?;双螺旋结构的多态性与Z-DNA
DNA的三级结构与三链DNA
snmRNAs与核酶
核酸的变性、复性和杂交
RNAi
;一、核酸的化学组成;二、DNA一级结构
四种脱氧单核苷酸(dAMP、dGMP、dCMP、dTMP)是DNA的基本组成单位,它们按照一定的方式、数量和排列顺序而形成的多核苷酸链即为DNA的一级结构。
书写:按5′→3′方向书写。
如:5′pACGT3′或pACGT、dACGT或5′dACGT3′、ACGT表示脱氧多核苷酸的结构。
DAN的一级结构决定种属差异;三、DNA的二级结构
1953年Watson和Crick在Chargaff规则和DNA X-射线衍射结果的基础上提出了著名的DNA双螺旋(double helix)结构模型,即B-DNA模型(图2-3)。模型的结构特征如下:
(1)两条反向平行的多核苷酸链围绕同一中心轴盘绕成右手双螺旋。
(2)核糖与磷酸在外侧形成螺旋的轨迹,彼此通过3′,5′- 磷酸二酯键相连。
(3)碱基伸向内部,其平面与螺旋轴垂直。; (4)两条核酸链依靠彼此碱基之间形成的氢键相连系而结合在一起,且总是A与T,G与C配对。
(5)双螺旋的平均直径为2 nm ,每个螺旋圈上升10对核苷酸,螺距为3.4 nm。
(6)沿螺旋中心轴方向看去,双螺旋结构上有两个凹槽,一个较宽深,称大沟(major groove),另一个较浅小,称小沟(minor groove)。;DNA双螺旋结构的多态性;B-DNA:Watson-Crick模型,右手螺旋,生理条件下DNA最稳定的结构形式;活性:B-DNA A-DNA Z-DNA;计算机模拟DNA双螺旋结构(蓝色)
大沟中结合着肽(红色);双螺旋结构的构象变异;Z-DNA的发现;Z-DNA的结构特点;Z-DNA存在的条件;Z-DNA的生物学意义;;双螺旋结构的稳定因素;四、 DNA的三级结构--DNA的拓扑结构;线状DNA形成的超螺旋;环状DNA形成的超螺旋;意义:DNA复制、转录的启动具有重要的调控作用。 ;DNA拓扑异构酶;拓扑异构酶作用特点
既能切断、又能连接磷酸二酯键
分类:拓扑异构酶Ⅰ; 拓扑异构酶Ⅱ
作用机制:;回文结构—DNA序列中以某一中心区域为对称轴,其两侧的碱基对顺序正读和反读都相同的双螺旋结构。即对称轴一侧的片段旋转180°后,与另一侧片段对称重复。回文结构能形成十字结构和发夹结构;; 同聚嘧啶和同聚嘌呤组成的DNA螺旋区段,其序列中有较长的镜像重复时,形成局部三股配对,并互相盘绕的三股螺旋,其中两股的碱基按Watson-Crick方式配对,第三股形成非Watson-Crick配对。 三螺旋DNA不是DNA在自然态下的主要结构,而是在特定的条件下形成的。 ;三碱基体;DNA三螺旋的碱基配对;DNA的三股螺旋;DNA的三股螺旋; RNA的一级结构是由数量极其庞大的四种核糖核苷酸(AMP、GMP、CMP、UMP)按一定顺序,通过3′,5′—磷酸二酯键连成的线形分子,其表示方法与DNA相同。
RNA的二级结构是短的,不完全螺旋的多核苷酸链。(天然RNA并不像DNA一样都是双螺旋结构,而是单链线形分子。只有局部区域为双螺旋结构。双螺旋区约占RNA分子的50%)
RNA的三级结构是在茎环结构基础上进一步扭曲折叠而成的复杂结构。RNA只有具备复杂的三级结构才能成为有活性的分子。; 这种由单链自身折叠形成的结构称为茎环结构。茎环结构是各种RNA的共同的二级结构特征。;第三节 核酸的功能;二、RNA的种类、分布、功能;四 、其他小分子RNA及RNA组学;snmRNAs的种类
核小RNA(snRNA):参与hnRNA 的剪接, snRNP,5种snRNA与蛋白质、剪接因子等共同构成剪接体。
核仁小RNA (snoRNA):参与rRNA 的加工与修饰,首次切割,甲基化,合成假尿苷。
胞浆小RNA(scRNA): scRNP
催化性小RNA
小片段干涉 RNA ;核酶(Ribozyme);锤头结构(hammer-head);;;在DNA变
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