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第二章 DNA的复制;一、DNA 复制假说;;Meselson-Stahl实验;;15N-DNA; 对15NDNA、14NDNA杂交分子经加热变性,对于变性前后的DNA分别进行CsCl密度梯度离心。;;* 1963年Cairns用放射自显影方法阐明了大肠杆菌DNA的复制是半保留复制且DNA是环状分子。;;;二、半保留复制;模板
原则
特点;;;2、DNA半保留复制的类型;2) 环状DNA:θ型(双向、单向)、
D型、滚环;;φX174RF是一个合成单链病毒圆环的模板;D型复制;3、参与DNA复制的物质;4)DNA聚合酶(DNA Polymerase):
以dNTP为前体催化合成DNA
需要模板和引物的存在
不能起始合成新的DNA链
催化dNTP加到生长中的DNA链的3’-OH末端
催化DNA合成的方向是5→3;A 原核生物聚合酶; 3’ 5’ 5’ 3’
外切酶 聚合酶;5‘-3’聚合活性:
? 模板;
? 3‘-OH末端引物;
? 方向从5’-3‘。;复制方向;5’-3‘外切酶活性:
? 从5’-P端依次切除,可连续切除多个核苷酸;
? 只切配对的5’-P末端核苷酸;
? 既可切除脱氧核苷酸也可切除核苷酸;
? 对只有5’末端的切口也有活性。;;MW为120KD
100个酶分子/每个细胞
聚合作用:只有DNApolⅠ的5%
3’→5’外切酶活性
无5→3外切酶活性
对作用底物的选择性较强
不是复制的主要聚合酶;pol Ⅲ由十种共22个亚基组成
α亚基具有5’→3’聚合DNA的酶活性
ε亚基具有3’→5’外切酶的活性
θ亚基具有促进ε亚基外切酶的活性;在复制叉处为一二聚体
核心酶(core enzyme):α、ε、θ。 α:聚合作用; ε:3’-5’外切;θ:与亚基结合有关;
γ、δ、δ’、χ、ψ提高反应速率和持续性;
β:使DNApol能结合在DNA上。β亚基结合于DNA时消耗ATP;如同一个夹子,使DNApolⅢ结合于DNA。
τ:使两个DNApol单体形成二聚体,分别在复制叉的两个链上作用。;DNA Polymerase III Holoenzyme;;;;B 真核生物聚合酶; DNA聚合酶 α β γ δ ε
蛋白质分子量(KD) 250 36-38 160-300 170 256
细胞定位 核 核 线粒体 核 核
? 5’ →3’聚合酶 有 有 有 有 有
3’ →5’外切酶 无 无 有 有 有
引物酶 有 无 无 无 无
;5) 解链酶(unwinding enzyme/ helicase ) ;;6) 引物酶(Primase);;蛋白因子i、n、n”与蛋白dnaC跟引物预合成有关;
蛋白因子n’和蛋白dnaB与识别复制起始点有关,并具有ATPase活性。;7)单链结合蛋白;;;8) 拓扑异构酶(topoisomerase):
可使DNA拓扑异构体互变的酶。;? 功能:与DNA形成共价结合中间体,使DNA磷酸二酯
键断裂,形成DNA nick,DNA的一条链进行解
旋旋转改变DNA分子的拓扑结构。
参与复制、转录、重组。
? 效应:可使DNA发生:连环化(catenate)、脱连环化
(decatenate)、打结(knot)、解结(unknot)。;拓扑异构酶Ⅰ:MW=100kD,单肽链,含3-4个Zn;;作用:
使正超螺旋转化为负超螺旋。每次改变两个连接数。;;;Ⅰ型:MW=95kD,单体蛋白,不需ATP;
Ⅱ型:MW=150-180kD,均为二聚体,需ATP和
Mg2+。;9) 连接酶;DNA连接酶的作用;? T4Ligase特性:
可连
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