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生物信息学第七章基因组信息学概述
生物信息学第七章 基因组信息学;*;*;*;*;*;人的基因图谱;*;果蝇的遗传图谱;*;限制作图;*;序列装配(sequence assembly);*;*;序列装配软件作业(Lasergene?SeqMan);*;基因芯片的作用和意义;基因芯片制备方法;在片(原位)合成法;2、点样法:首先按常规方法制备cDNA(或寡核苷酸)探针库,然后通过特殊的针头和微喷头,?分别把不同的探针溶液,逐点分配在玻璃、尼龙或者其它固相基底表面上不同位点,并通过物理和化学的结合使探针被固定于芯片的相应位点。这种方式较灵活,探针片段可来自多个途径,除了可使用寡聚核苷酸探针,也可使用较长的基因片段以及核酸类似物探针(如PNA等)。
探针制备方法可以用常规DNA探针合成方法、或PCR扩增的cDNA、EST文库等。固定的方式也多种多样。
点样法的优越性在于可以充分利用原有的合成寡核苷酸的方法和仪器或cDNA探针库,探针的长度可以任意选择,且???定方法也比较成熟,灵活性大适合于研究单位根据需要自行制备科研型基因芯片,制作点阵规模较小的商品基因芯片。;生物信息学在基因芯片中的作用;芯片设计;基于芯片的序列分析;单探针和多探针的突变检测芯片设计示意;基于芯片的基因功能分析;基因芯片检测结果的分析;基因芯片信息的管理和利用;*;*;一些概念;PCR引物的设计原则(黄金法则);*;其他引物设计及分析软件;Primer Premier 6.0 (win7)演示
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