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18基因表达调控资料
生物化学与分子生物学;第十八章;第一节基因表达与基因表达调控的基本概念与特点;一、基因表达是基因转录和翻译的过程;二、基因表达具有时间特异性和空间特异性;(二)空间特异性是指多细胞生物个体在特定生长发育阶段,同一基因在不同的组织器官表达不同 ;三、基因表达的方式存在多样性;按对刺激的反应性,基因表达的方式分为:;(一)有些基因几乎在所有细胞中持续表达;(二)有些基因的表达受到环境变化的诱导和阻遏;在一定机制控制下,功能上相关的一组基因,无论其为何种表达方式,均需协调一致、共同表达,即为协同表达(coordinate expression),这种调节称为协同调节(coordinate regulation)。;四、基因表达调控受顺式作用元件和反式作用因子共同调节;五、基因表达调控呈现多层次和复杂性;六、基因表达调控为生物体生长、发育的基础;(二)生物体调节基因表??以维持细胞分化与个体发育;第二节 原核基因表达调控;原核生物基因组结构特点;原核生物大多数基因表达调控是通过操纵子机制实现;操纵子模型的普遍性;图18-1 5种E.coli启动序列的共有序列;基因表达有正调控和负调控;调节基因(regulatory gene)编码能够与操纵序列结合的调控蛋白,可以分为三类:特异因子、阻遏蛋白和激活蛋白。 ;② 阻遏蛋白可以识别、结合特异DNA序列──操纵序列,抑制基因转录,所以阻遏蛋白介导负调节(negative regulation)。阻遏蛋白介导的负性调节机制在原核生物中普遍存在;
③ 激活蛋白可结合启动序列邻近的DNA序列,提高RNA聚合酶与启动序列的结合能力,从而增强RNA聚合酶的转录活性,是一种正调控(positive regulation)。 ;二、乳糖操纵子是典型的诱导型调控;图18-2 lac 操纵子与阻遏蛋白的负性调节;;;+ + + + 转录;3. 协同调节;;图18-3 CAP、阻遏蛋白、cAMP和诱导剂对lac操纵子的调节 ;三、色氨酸操纵子通过转录衰减的方式阻遏基因表达;四、原核基因表达在转录终止阶段有不同的调控机制;五、原核基因表达在翻译水平的多个环节受到精细调节 ;图18-4 色氨酸操纵子的结构及其关闭机制;(二)蛋白质分子结合于启动序列或启动序列周围进行自我调节 ;(三)翻译阻遏利用蛋白质与自身mRNA的结合实现对翻译起始的调控;(四)反义RNA结合mRNA翻译起始部位的互补序列对翻译进行调节;(五)mRNA密码子的编码频率影响翻译速度;第三节 真核基因表达调控;一、真核细胞基因表达的特点; ④ 原核生物的基因编码序列在操纵子中,多顺反子mRNA使得几个功能相关的基因自然协调控制;而真核生物则是一个结构基因转录生成一条mRNA,即mRNA是单顺反子(monocistron),许多功能相关的蛋白、即使是一种蛋白的不同亚基也将涉及到多个基因的协调表达;⑤ 真核生物DNA在细胞核内与多种蛋白质结合构成染色质,这种复杂的结构直接影响着基因表达;
⑥ 真核生物的遗传信息不仅存在于核DNA上,还存在线粒体DNA上,核内基因与线粒体基因的表达调控既相互独立而又需要协调。 ;图18-5 真核生物基因表达的多层次复杂调控;二、染色质结构与真核基因表达密切相关;(二) 转录活化染色质的组蛋白发生改变 ;组蛋白修饰对于基因表达影响的机制也包括两种相互包容的理论。即:组蛋白的修饰直接影响染色质或核小体的结构,以及化学修饰征集了其他调控基因转录的蛋白质,为其他功能分子与组蛋白结合搭建了一个平台。这些理论构成了“组蛋白密码”的假说。;组蛋白;(三) CpG岛甲基化水平降低;三、基因组中的顺式作用元件是转录起始的关键调节部位;图18-7 顺式作用元件;(一)真核生物启动子结构和调节远较原核生物复杂;CCAAT盒;(二)增强子是能够提高转录效率的顺式调控元件;(三)沉默子能够抑制基因的转录;四、转录因子是转录调控的关键分子;真核基因的调节蛋白;图18-8 反式与顺式作用蛋白;通用转录因子(general transcription factors);特异转录因子(special transcription factors);转录调节因子结构;最常见的DNA结合域:;碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)
;常结合CAAT盒;五、转录起始复合物的动态构成是转录调控的主要方式;图18-12 转录起始复合物的形成 ;六、转录后调控主要影响真核mRNA的结构与功能;与原核基因表达调节一样,某些小分子RNA也可调节真核基因表达。
这些RNA都是非编码RNA(noncoding RNA, ncRNA)。如:具有催化活性的RNA(核酶)、细胞核小分子RNA (snRNA)以及核
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