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化学与生命起源主题(bydongxinhu)资料
化学生物学与生命起源Chemical Evolution;;;;;;origin of matter solar;HC-C-CN;;(一)膜的起源
(二) t-RNA的起源
(三)遗传密码子的起源
(四)核酸与蛋白的耦合
(五)磷在生命起源中的重要作用
;Origin of Membrane
Origin of t-RNA
Origin of Genetic Code
Coupling between Nucleic acid and protein
Phosphorus and Chemical Evolution;I. Origin of Membrane; 2.Wallach-Zahler model
Wallach和Zahler1966年提出了具有主导地位的膜蛋白结构模型。这一新模型被就是著名的流动镶嵌模型。 Danielli 和Davson模型中提出的磷脂双分子层被保留,但是新模型中蛋白质分子以两种形式存在于磷脂双分子中:内在蛋白和外在蛋白。而这些蛋白分子的构象以跨膜的α-helices。接下来的问题是关于膜的起源,磷脂和膜蛋白哪个先出现。;3.Fatty acid model
最新的膜起源模型提出原始海洋中可能通过Fischer-Tropsch反应利用二氧化碳、一氧化碳和水进行脂肪酸的积累。如果烷基侧链具有相当长度,这些脂肪酸可能会自发地形成酯质双分子层,由此生成最原始的膜结构。磷脂双分子层的的产生可能是后期的一个变化过程。但是这一观点的最大争议点是,提出的膜结构在金属离子(如钾)和单体(如氨基酸)中相对不稳定。实事上,如果这种膜结构中出现蛋白质和聚核苷就会破裂。原因出在这种膜对水的渗透性,渗透压导致囊泡的破裂。
;4. Orgel model
Orgel于1987年提出了以聚合多肽为基础的另一种模型。“最早的编码多肽可能在多孔渗水膜或胶体中用于聚集指导其合成的聚核苷”。根据Orgel提出的模型,原始膜由多肽组成,这些多肽则由疏水-亲水交替的氨基酸聚合连接而成,这些氨基酸通过一些简单的聚核苷编码生成。
Orgel L, Evolution of the genetic apparatus: a review, Cold Spring Harb Symp Quant Biol 52: 9-16
Brack 和Orgel在1975年通过实验研究疏水-亲水交替的氨基酸正交聚合。实验表明聚leucyl-lysine 在盐溶液中通过疏水基团成簇形成不对称的内部疏水外部疏水的双分子层。
Brack A, Orgel L, β structure of alternating polypeptides and their possible prebiotic significance, Nature 256: 383-387;5. Phosphoryl amino acid model;II. Origin of t-RNA;2. RNA microhelice model
利用甘氨酸或丙氨酸对微螺旋状物和对最小限度tetroloop进行酰化的研究提出了更小的t-RNA前体。“t-RNA分子可能通过RNA微螺旋的进一步区分和修饰衍生出来”。;3. Schimmel model
根据以上的观点,Schimmel于1993年提出目前t-RNA分子的两个领域起源于hair-pin stem-loop的寡聚核苷,并且这种寡聚核苷最终聚集在一起形成t-RNA分子L型结构。
Schimmel P et al, An operational RNA code for amino acids and possible relationship to genetic code, Proc Natl Acad Sci USA 90:8763-8768;III. Origin of Genetic Code;1.??Vocabulary expansion model
1975年提出的‘字母’扩充模型中假定最早的密码是(GC)码,对应氨基酸的情况是glycine(GG),Proline(CC),alamine(GC),“arginine”(CG)。(GC)码引入A后进化成(GCA)码,对应的氨基酸也增加了glutamic acid,aspartic acid,glutamine,asparagine,lysine,histidine,threonine,serine。最终引入U构成(GCAU)码,对应的氨基酸也增加了valine,leucine,isoleucine,methionine,phenyalanine
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