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- 2016-07-25 发布于安徽
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基于个性化生物医学研究的两种新ArrayTrack库;历史背景;内容简介;SNP数据库;SNP数据库;SNP数据库;QTL数据库;QTL数据库;QTL数据库;基因-营养交互,也就是说在某营养环境下找出与某些疾病相关的基因。通过手工去定位这些基因的位置是相当复杂和耗时的。QTL库通过搜索和收集数据和提供基于查询界面,我们能过快速而有效地定位这些基因的QTLs。
基因-营养交互策略大致分为两步来完成:
1.选择一种营养成分,如硫胺素,叶酸,核黄素,葡萄糖,果糖,维生素A,维生素D和维生素E等。
通过GeneGo或其他类似的路径搜索工具来搜索
参与该营养成分新陈代谢的基因列表。;2.使用QTL库,将每一基因会映射在促进某种表性特征的QTLs上。这新表性特征主要是遗传变异性引起的一些疾病(如肥胖,2型糖尿病,心血管疾病等)。这样,每个参与营养代谢促使某些疾病症状的基因的具体QTLs信息将会被找到。如:基因名,QTL名,染色体起止位置等。;为了识别潜在地存在于这些疾病进程中果糖代谢路径的基因,一种路径分析程序—GeneGo被使用。总共有34种基因是用于果糖代谢的(鼠版)。这些。通过QTL库搜索,指定扩展搜索范围5Mbp(百万碱基对),我们发现这些参与果糖代谢的34种基因与总共108种QTLs有关。这些结果再经过过滤仅仅只保留那些与肥胖,2型糖尿病和心血管疾病相关的QTLs。过滤后参与果
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