药物设计学第六讲QSAR与药效团解答.ppt

*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;此外，CoMFA仅考虑立体场和静电场 所选用的分子势能函数在某些格点附近会出现显著变化，出现异常数值，需要定义能量的截断（cut off）值，导致某些区域的分子场信息不能很好的表达。;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;(一) 氢键受体;(二) 氢键给体;需要特别指出的是，由于配体与受体之间的氢键相互作用一般具有明确的方向性，因此对于一个氢键给体或受体的描述，仅仅靠一个点是不够的。在药效团模型软件中(Discovery Studio, Catalyst)，一般都采用两个点来描述氢键特征，一个点表示氢键特征中重原子的空间位置，而另一个点表示氢键给体或受体的矢量方向。;(三) 疏水中心;(四) 芳环中心;(五) 电荷中心;正电荷中心包括： A．带正电荷的原子； B．伯、仲、叔脂肪胺中的氮原子； C．氮-氮双取代的脒基中的亚氨氮原子或三氮取代的胍基中的亚氨氮原子；;负电荷中心包括： A．带负电的原子； B．三氟甲基磺酰胺中的氮原子； C．羧酸、亚磺酸或磷酸中羟基氧； D．磷酸二酯和磷酸酯中羟基； E．硫酸和磺酸中羟基氧； F．磷酸单酯和磷酸中两个羟基氧； G．四唑中的氨基氮原子。;(六) 排斥体积;*;*;