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第二讲 核酸提取技术
Part Two
Techniques of Nucleic Acid Isolation;第一部分:DNA提取方法简介; 核酸是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,因此核酸的提取是分子生物学实验技术中最重要、最基本的操作 。
;第一部分:DNA提取方法简介;;DNA提取的几种方法;DNA提取的几种方法;基因组DNA- CTAB法; CTAB提取缓冲液的经典配方; CTAB提取缓冲液的改进配方;基因组DNA- CTAB法; CTAB法流程图; CTAB法实例
1、1.5ml离心管中加入0.3ml提取液置65℃预热。
2、取材料0.03g,用液氮研磨(加入0.003gPVP及少许石英沙)迅速研磨成粉。
3、将冻粉迅速转入提取液中,尽快用移液枪混匀,在温度65℃水浴30min,期间轻轻摇动几次(防止DNA断裂)。
4、取出离心管,冷至室温,每管加等体积氯仿/异戊醇(24:1),轻轻混匀,颠倒混匀静止10min,10000rpm离心10min。
5、吸取上清夜于另一离心管中,加入1/10体积的3%CTAB,混匀;再加入等体积的氯仿/异戊醇(24:1),轻缓颠倒混匀,室温放置15min,然后10000rpm离心10min去上清。
6、分别用70%、80%酒精洗涤沉淀。在风扇下将沉淀吹干。; CTAB法实例
7、加30μlTE缓冲液回溶DNA沉淀(不要反复吸打,用手指轻弹),同时加入终浓度50μl/mg RNase,置37℃处理1h。
8、加入等体积的氯仿/异戊醇 (24:1)抽提1-3次。
9、吸取上清,加入终浓度为0.2-0.4mol/l的NaCL,2倍体积的无水乙醇,放置1h左右,10、12000rpm 离心 10min 除去上清夜。
11、用70%乙醇洗涤沉淀2-3次,自然干燥后,溶于30μl去离子水中形成DNA提取液。
12、以DNA提取液/去离子水 1/100的比例加入石英杯中在蛋白质核酸分析仪中进行测定。; SDS法原理; SDS法流程图 (以动物组织为例) ; SDS法实例
1、取0.03g新鲜材料,置液氮中研磨成粉。
2、将冻粉转移置65℃预热的450μl DNA提取液中,轻轻晃动,使冻粉充分散开。
3、加入30μl 10%SDS充分混匀,置65℃水浴中保温10-15 min (间隔晃动2-3次)
4、加入48μl KAC充分混匀,冰浴中放置30 min 。
5、4℃ 12000rpm 离心15 min。
6、上清转入另一离心管中,加入等体积氯仿/异戊醇(24:1),轻扣,倒离心管数次,放置片刻,于4℃8000rpm离心10min。
7、按6-7重复1-2次。
8、将上清转移另一离心管,加入2倍体积冷无水乙醇。轻缓摇匀,置-20℃沉淀0.5-1h。4℃ 10000rpm离心10min。
;9、倒掉上清,用70%乙醇洗涤沉淀2-3次,吹干后,用30μl去TE缓冲液溶解沉淀。
10、DNA溶液加入RNase 1μl,于37℃保温0.5-1h。
11、用等体积的氯仿/异戊醇(24:1)抽提1-3次
12、70%乙醇洗涤沉淀2-3次,自然干燥后,溶于30μl 去离子水形成DNA提取液。
13、以DNA提取液/去离子水 1/100的比例加入石英杯中在蛋白质核酸分析仪中进行测定。
一步法:
1、0.03mg材料,加200μl 0.5mol/l NAOH研磨后,取60μl研磨液,加300μl 100mol/l Tris-HCL(PH 7.6)缓冲液中8000rpm离心5min,取上清即为DNA提取液。
2.以DNA提取液/去离子水 1/100的比例加入石英杯中在蛋白质核酸分析仪中进行测定。;基因组DNA-其它方法;基因组DNA-其它方法;基因组DNA-其它方法;质粒DNA-碱裂解法; 碱变性;质粒DNA-碱裂解法;;注意:
用移液器操作时,每一步都要格外小心,特别是在加入溶液II 和III后,一定不要剧烈振荡,以免切碎DNA(包括质粒DNA和基因组DNA)!!!;培养细菌:将带有质粒的大肠杆菌接种到1.5-3ml含有相应抗生素的液体培养基,37℃培养12~16小时;
取液体培养液1.5-3ml于Eppendorf管中,10000r/min离心1min,去掉上清液,加入100?l溶液1(GET) ,充分混匀放置3-5分钟;
加入200?l新配制的0.2mol/L NaOH+1%SDS(变性液),加盖颠倒6-7次使之混匀,冰上放置5min;;加入150 ? l乙酸钾溶液(溶液II),加盖后颠倒6-7次混匀,冰上放置5min;
用台式高速离心机,10000r/min离心7min,上清移入另一干净离心管,并加1ml 100%乙醇混匀,12000r/min离心
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