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- 2016-08-02 发布于湖北
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环境化学_有机污染物的定量结构-活性关系
2、QSAR对于有机化学品环境风险评价的作用 CAS登记的化学品3668万 通过QSAR,可以弥补有机物环境行为与生态毒理数据的缺 失,大幅度降低实验费用,有助于减少和替代实验。 1、有机污染物QSAR的建立方法及代表性模型 P262图6-1 QSAR建模经常使用的模型: (1)线性自由能关系模型 (2)Hansch模型 (3)线性溶解能关系模型 (4)理论线性溶解能关系 (5)基团贡献模型 (6)三维QSAR分析方法 QSAR模型应符合的标准: 具有明确定义的环境指标 具有明确的算法 定义了模型的应用域 有适当的拟合度、稳健性和预测能力 最好能够进行机理解释 决定系数(R2) 经自由度调整后的决定系数(R2adj) 均方根误差(RMSE) 1、交叉验证 2、自举法和Y的随机性验证 1、预测能力 (1)外部数据集作为验证集 (2)原始数据集的子集作为验证集 2、QSAR模型的应用域 (1)描述符变化范围 (2)结构相似性 (3)机理相似性 (4)新陈代谢 有机物理化性质的机理 有机污染物环境行为的机理 有机物毒理学效应的机理 * 第六章 有机污染物的定量结构-活性关系(QSAR) ? 内容 第一节 概述 第二节 分子结构的参数化表征 第三节 QSAR模型的建立方法 第四节 QSAR模型的验证与表征 ? 内容 第一节 概述 一、QSAR的基本概念和意义 二、QSAR的原理与发展趋势 三、QSAR的发展和应用 四、环境指标与数据的获得 ?一、QSAR的基本概念和意义 1、定量结构-活性关系的基本概念 QSAR:有机物的物理性质、环境行为和生态毒理学参数,与其 分子结构之间存在的内在联系。这种联系可以被认识、 表征和应用。 QSAR模拟的环境指标: (1)有机污染物的理化性质 (2)有机污染物在环境中迁移转化行为的参数 (3)毒理学参数 ?一、QSAR的基本概念和意义 ?二、有机污染物QSAR的原理与发展趋势 ?二、有机污染物QSAR的原理与发展趋势 2、QSAR的发展趋势与特点 (1)目标导向性和应用性 (2)多学科集成性 (3)智能性 ?三、QSAR的发展和应用情况 ?四、QSAR所模拟的环境指标和活性数据的获得 1、训练集化合物的选择 随机性、代表性、全面性、可获得性 2、活性数据的获得 文献资料、相关数据库、实验室的测试结果 第二节 分子结构的参数化表征 一、分子结构线性输入系统 二、经验性分子结构参数 三、分子拓扑学参数 四、量子化学参数 ?一、分子结构线性输入系统 分子线性输入系统(SMILES):高度浓缩和简洁的方式, 表达化学结构的性质。 基本规则: 原子由各自的原子符号表示 氢原子略写 相邻的原子表示彼此相连 双键和三键用“=”和“#”表示 分支用括号表示 环用分配的数字来表示两个连接的原子 ?二、经验性分子结构参数 1、取代基电子效应参数(σ) 2、立体效应参数(Es) 3、疏水性参数(π) ?三、分子拓扑学参数 分子拓扑学是把数学上图的拓扑性质与化学分子结构图对应 起来,用于寻找分子结构图的拓扑学参数。 ?四、量子化学参数 1、原子电荷 2、分子轨道能 第三节 QSAR模型的建立方法及其透明性 一、建立QSAR模型的方法 二、QSAR建模算法的透明性 ?一、建立QSAR模型的方法 1、回归分析法 回归分析法,是在掌握大量观察数据的基础上,利用数理统计方法建立因变量与自变量之间的回归关系函数表达式(回归方程式)。 2、多变量分析法 主成份分析,因子分析、聚类分析、判别分析、偏最小二乘 分析 3、其他分析方法 人工神经网络分析、遗传算法 ?二、QSAR建模算法的透明性 透明性:模型应基于基本的物理化学性质,并具有清晰明确 的表达形式。 第四节 QSAR模型的验证与表征 一、QSAR模型的拟合效果评价 二、QSAR模型的稳健性及内部验证 三、QSAR模型的预测能力与应用域 四、QSAR模型的机理 ?一、QSAR模型的拟合效果评价 ?二、QSAR模型的稳健性及内部验证 ?三、QSAR模型的预测能力与应用域
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