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真核生物基因表达调控可分为: 瞬时调控或称可逆性调控(相当于原核生物对环境条件变化所做出的反应:如某种底物或激素水平的升降,或者细胞周期不同阶段中酶活性的调节) 发育调控或不可逆调控(决定真核细胞生长、分化、发育的全部过程) 2.1真核生物的基因结构与转录活性 真核生物mRNA单顺反子 真核生物DNA与蛋白质结合(组蛋白、非组蛋白) 高等真核生物DNA大部分不转录的 真核生物转录与翻译在不同细胞部位发生 许多真核生物的基因要经过复杂的成熟和剪接过程之后才能被顺利翻译 2.1.1基因家族 真核细胞中许多相关的基因按功能成套组合,被称为基因家族,同一基因家族中的成员有时紧密排列在一起,被称为基因簇。 它们一般位于同一染色体的的不同部位,或者不同染色体上,具有各自不同的表达调控方式。 Processing of rRNA transcripts (in bacteria) rRNA processing in vertebrates 复杂多基因家族 海胆五种组蛋白基形成一个重复单位,每种组蛋白基因之间是非转录间隔区,5个间隔区均不相同。 这样的重复单位在整个基因组中重复可达1000次,而且这些重复单位基本上是相同的。 在海胆中,5种组蛋白基因的转录方向都是相同的,每种组蛋白基因独立的产生自己的mRNA。 发育调控的复杂多基因家族 血红蛋白:所有动物体内输送分子氧的主要载体。 成年人血红蛋白有两条α链两条β链组成。 Globin Gene Organization Expression of Different Globins 珠蛋白基因表达的调控 染色质结构的变化 DNase I sensitivity shows general change in chromatin organization Histone acetylation/deacetylation DNA甲基化影响转录 Dnase敏感性与基因表达 转录基因对 DNase I的敏感性大于非转录的DNA 用于衡量染色质可与转录因子结合的难易 有些位点对 DNase I的敏感性极高 – 超敏感位点,可能缺乏核小体结构 结论:转录基因染色质的组织形式与非转录基因的组织形式不同 Methylation Affects Globin Regulation Extron size Intron size 变位剪接(Alternative splicing) Sex determination in D. melanogaster(黑腹果蝇)involves a pathway in which different splicing events occur in females. Blocks at any stage of the pathway result in male development. 2.1.3 真核生物DNA水平上的基因表达调控 用来合成RNA的DNA模板也会发生规律性变化,从而控制基因表达和生物的发育。 开放型活性染色质结构对转录的影响 染色质按其伸展程度分为活化染色质和非活化染色质。 非活化染色质DNA不能被转录,其特点是以30nm染色质螺线管结构为基础,DNA压缩40-50倍。30nm染色质螺线管结构开启为可以转录的伸展(疏松)染色质结构,成为10nm的染色质丝,此时DNA压缩6倍。在细胞中染色质的活化与非活化态是可逆的,并有不同的中间状态。 DNase I超敏感位点 胰DNA酶(DNase I)可以均一地切割纯化的DNA,对DNA的降解无明显的序列特异性。 用DNase I消化来自不同组织的染色质但得到的结果不同,例如在红细胞前体的细胞核中,编码珠蛋白mRNA的DNA序列对DNase I的作用比其它序列更敏感,而在母鸡输卵管细胞核中,卵白蛋白的DNA序列对DNaseI敏感性比珠蛋白序列更高。 活化态基因对酶的高敏感性说明,活化态基因上的蛋白质构象的保护性作用比末活化的要小。 基因扩增 基因扩增是指某些基因的拷贝数专一性大量增加的现象,它使细胞在短期内产生大量的基因产物以满足生长发育的需要,是基因活性调控的一种方式。 基因重排与交换(p334-347) 将一个基因从远离启动子的地方移到距它很近的位点从而启动转录,这种方式被称为基因重排。 2.1.4 DNA甲基化与基因活性的调控 大量研究表明,DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则能诱导基因的重排活化和表达。 DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性以及DNA与蛋白质的相互作用方式的改变,从而控制基因的表达。 DNA甲基化主要形成5-甲基胞嘧啶和少量的N6-甲基腺嘌呤及7-甲基鸟嘌呤。 CpG岛: CpG二核苷酸通常成串出现在DNA上,这段序列往往被为CpG岛。 CpG is
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